郑州市第六人民医院擅长皮肤性病科、感染科、肝硬化科、结核病与危重症科、中西医结合肿瘤科，这些科室都有着高超的诊疗技术，患者可根据自身需求选择。
1、皮肤性病科
由性病诊疗中心、性病实验室、皮肤病门诊、医学美容部和皮肤性病病区五部分组成，是该省收治性病和皮肤病的公立、非盈利性特色专业科室。其中性病诊疗中心是河南省卫生健康委批准的性病定点诊疗机构。
2、感染科
是全国最早收治艾滋病的专业机构、中医药防治传染病重点研究室（临床基地）建设单位、国家卫生部艾滋病临床培训基地、河南省艾滋病临床治疗中心，是国家GCP中西医结合艾滋病专业机构、河南省首批艾滋病临床医学研究中心。在艾滋病各种机会性感染的诊治、规范化抗逆转录病毒治疗、药物毒副作用的处理等方面处于国内领先水平。
3、肝硬化科
是集医疗、科研、教学三位一体的临床科室，为“河南省医学肝病学重点学科”。肝硬化科团队是支知识底蕴深厚、梯队建设完善、技术力量过硬的医护队伍，独具特色诊疗手段。擅长治疗各类肝硬化、疑难重症肝病诊疗，并联合国际先进的生物免疫治疗，及传统中医药调理，以个体化方案治疗为理念，制定符合个体疾病特点的诊疗计划与诊疗方案，临床治愈率达97.3%。
4、结核病与危重症科
擅长诊治各型肺结核、肺外结核及其他呼吸道疾病，承担河南省结核病诊疗质量控制中心巡查巡诊和郑州市结核病重点实验室建设工作。建科以来，取得了较大的成效，学术影响力逐渐扩大，先后获得了郑州市结核病重点学科，郑州市结核病重点实验室，河南省结核病重点培训学科，河南省结核病诊疗质量控制中心，在结核病学科前沿领域从国家“十一五”开始与北京胸科医院、复旦大学附属华山医院和上海肺科医院等国内知名团队长期合作。
5、中西医结合肿瘤科
是一个集医疗、科研、教学、预防为一体的肿瘤综合临床基地，以肿瘤综合治疗、中西医结合治疗、姑息心理康复为特色。治疗理念与国内国际先进水平同步，在普通肿瘤研究基础上，致力于AIDS合并肿瘤、结核合并肿瘤、原发性肝癌的诊断及治疗，具有丰富的临床经验，处于国内领先水平。