联勤保障部队第909医院擅长的科室有烧伤整形科、骨科、消化内科、神经外科、胸外科等。
1、烧伤整形科
联勤保障部队第909医院烧伤整形科，制定了一套较完整的平战时成批烧伤救治的应急保障预案，为军地突发公共卫生事件成批伤员救治提供良好保障。先后对20多批烧伤伤员实施救治，成功率达到国内领先水平。对特大面积烧伤患者，综合运用多种新技术和治疗方法，提高抢救成功率。整体救治水平居国内领先水平。可开展MEEK微型皮片移植技术，有效解决大面积深度烧伤患者自体皮源不足的困难。并制作了全军手术示范片。
2、骨科
联勤保障部队第909医院骨科是全军专科中心，设有四个医疗科室、一个康复理疗中心、一个中心实验室。开展了全脊柱整块切除治疗脊柱肿瘤、上颈椎骨折脱位内固定术、脊柱畸形矫形术和复杂颈腰痛诊疗；膝关节镜、肩关节镜、踝关节镜和髋关节镜技术等，处于国内先进水平。
3、消化内科
联勤保障部队第909医院消化内科设有消化内科病区及消化内镜中心两个病区。科室配有电子胃镜、超细胃镜、电子肠镜、超声内镜、胶囊内镜、电子十二指肠镜、大型C臂机、激光刀、氩气刀、结肠灌注透析治疗仪、单气囊小肠镜、麻醉机、内镜专用吊塔、内镜信息建设网络管理平台等一系列高新数字化医疗设备。科室在消化道大出血、炎症性肠病、肝硬化、胰腺炎等疾病的诊断、治疗、抢救方面积累了丰富的临床经验。
4、神经外科
联勤保障部队第909医院神经外科，设有2个医疗病区、1个神经专科重症监护病区（NICU)。拥有美敦力S7神经导航系统，Neurologic移动CT等一大批国际先进、国内领先的医疗器械。开展三甲医院神经外科专业全部诊疗项目，学科门类齐全，包括颅脑创伤、颅脑肿瘤、脑血管病、功能神经外科及脊柱脊髓疾病亚专业，技术总体水平达到军内、省内先进水平。
5、胸外科
联勤保障部队第909医院胸外科，常规开展心脏、大血管、肺部、食道、纵隔、胸壁、严重胸外伤等疾病的治疗。科室设备齐全，拥有史托斯胸腔镜系统、MAQUET体外循环机、西门子多功能呼吸机、惠普多功能心脏监护仪、日本微量推注泵及输液泵、美国心脏临时起搏器等先进仪器和专科ICU病房全套设备。