北京儿科医院排名靠前的是首都医科大学附属北京儿童医院普通内科、北京大学第一医院儿科、首都儿科研究所附属儿童医院内科等。首都医科大学附属北京儿童医院普通内科连续三年位居复旦版全国儿科专科排名第2位，下设的新生儿中心年救治各类新生儿超4000例，危重新生儿转运成功率100%，救治实力领跑全国。北京大学第一医院儿科2021-2022年连续位居复旦版全国儿科专科排名第6位，是我国最早建立的现代儿科之一，也是中国小儿外科的发源地，多个亚专业诊疗技术达国际领先水平。首都儿科研究所附属儿童医院内科获2023年复旦版全国专科声誉排名提名，开设8个儿科亚专业门诊，年门诊量40万-50万人次，全年无假日开诊服务便捷。
1、首都医科大学附属北京儿童医院 普通内科
该科室连续三年（2021年全国专科综合排名、2022-2023年全国专科声誉排名）位列复旦版全国专科排名第2位，学科发展积淀深厚，1972年内科正式成立，经多轮学科整合，目前形成含新生儿内科病房、NICU、新生儿外科病房的新生儿中心。诊疗数据亮眼，年救治普通新生儿患者近3000例、NICU年救治危重新生儿约1500例，两类患者抢救成功率均达99%，率先在国内开展的新生儿溶血病换血术成功率100%；作为北京市新生儿急救转运救治中心，危重新生儿转运成功率达100%，配套全系列进口先进救治设备，常规开展各类新生儿救治护理技术，同时承担多层次儿科教学任务，参与编写《实用儿科学》等多部权威儿科专业书籍。
2、北京大学第一医院 儿科
该科室位列2021年全国专科综合排名第6位、2022年全国专科声誉排名第6位，是我国最早建立的现代儿科之一，学科资质硬核，1926年建立独立儿科病房，1929年率先在国内成立儿科教研室，1981年成为国家首批儿科博士点，1992年设立博士后流动站，连续三轮获评国家重点学科，拥有儿科遗传性疾病分子诊断与研究北京市重点实验室，是多个国家级、市级儿科诊疗、培训基地的牵头或成员单位。科室分设儿内科、小儿外科，其中小儿外科由张金哲院士创立，是中国小儿外科发源地，小儿脑积水年手术量超500例，是国内最大的小儿脑积水诊治中心，相关技术达国际领先水平；腹腔镜微创治疗先天畸形、胎儿医学产前诊疗等领域也居国际先进水平，所属胎儿医学中心为北京市唯一，已完成1200余例产前咨询及诊疗。
3、首都儿科研究所附属儿童医院 内科
该科室获2023年复旦版全国专科声誉排名提名，以儿科常见病、多发病诊疗为核心，开设神经、呼吸、内分泌、肾脏、血液、心血管、新生儿、消化8个亚专业门诊，在儿童发热、咳嗽、哮喘、婴儿便秘等儿童常见病症诊治上具备显著优势。科室严格把控出诊人员资质，专家门诊、专业门诊均由副主任医师以上职称人员出诊，普通门诊由具备3年以上临床经验的主治医师、高年住院医师出诊，诊疗规范性强。科室服务设置充分贴合患儿就医需求，门诊全年无假日，年就诊量达40万-50万人次，是北京儿童常见疾病诊疗的核心阵地。
4、北京协和医院 儿科
该科室获2023年复旦版全国专科声誉排名提名，学科历史积淀深厚，1921年伴随北京协和医院建院成立，孕育了中国儿科发展的奠基人和多位儿科大家，是中国现代儿科的发祥地，科室依托协和医院作为全国疑难重症诊治指导中心的整体优势，在早产儿救治、遗传病诊断、儿科疑难罕见病诊治领域享誉国内，多年来为大量疑难病、罕见病患儿明确诊断并开展及时规范治疗，为诸多患病家庭重建了生活希望。目前科室设置七大专业组，依托综合医院的多学科支撑能力始终保持行业高水平，多次获得各级医疗科研成果奖励，是国内儿科疑难重症诊治的核心高地之一。
5、中国人民解放军总医院 小儿内科
该科室是解放军总医院儿童医学中心的重要组成部分，与301儿外科、304儿科共同承担医疗、教学、科研、保健四大任务，为南开大学儿科学博士、硕士学位培养点及儿科学博士后科研工作站，2004年正式获批儿科学博士授权点，多位专家任职全国性学术团体。科室设2个病区共150张床位，划分7个特色亚专业，其中儿童血液肿瘤诊疗达国内领先水平，1989年率先在国内开展儿童自体外周血干细胞移植治疗血液肿瘤，急性淋巴细胞白血病5年无病存活率超70%；小儿神经诊疗康复一体化、儿童保健等领域优势突出。近5年发表第一作者论文181篇，其中SCI论文43篇，承担各类课题23项、累计经费380万元，获多项省部级以上医学奖项。
