温州医科大学附属眼视光医院擅长白内障专科、眼底病科、斜视弱视专科、青光眼专科、整形美容科等。
1、白内障专科
温州医科大学附属眼视光医院白内障专科创立于1996年，科室是全国最大的白内障诊疗中心之一，特色性地开展屈光性眼内手术（治疗白内障、高度近视、散光、老视）及复杂性白内障手术，年手术量全国公立医院前三。在国际上，首次提出白内障手术时机的部分评价指标；在国内，最早一批开展飞秒激光白内障手术，最早开设老视门诊，引入多焦点人工晶体。
2、眼底病科
温州医科大学附属眼视光医院眼底病科分为眼底内专科和眼底外专科。科室能治疗复杂性视网膜脱离、严重糖尿病性视网膜病变、增殖性玻璃体视网膜病变等各类疑难眼底病症。全科同仁以挑战疑难眼病、救治濒危眼球为己任，业务上精益求精，科研上勇于探索，以不断创新的进取精神为各类眼底病患者送去光明。
3、斜视弱视专科
温州医科大学附属眼视光医院斜视弱视专科拥有18个独立诊室，1个检查室，1个弱视与双眼视觉训练室。科室利用框架眼镜矫正近视、远视和散光等各种屈光不正，包括利用各种软镜、硬性接触镜矫正。对弱视儿童及成人进行屈光矫正，并制定个性化的弱视训练方案治疗弱视。还开展儿童及成人的斜视手术，以及各类复杂斜视的手术矫正等。
4、青光眼专科
温州医科大学附属眼视光医院青光眼专科创建于1998年，每年接诊来自全国28个省市患者2万余人，年手术2000余例，外省市患者超过40%。科室发现并提出OCT检查评估原发性急性闭角型青光眼急性发作后视神经损害的时机；率先开展眼内窥镜下房角分离术；率先提出和开展穿透性粘小管成术等。
5、整形美容科
温州医科大学附属眼视光医院整形美容科由整形整容中心和激光美容中心两大部分组成，专科具有国内一流水平的专业医护人员和完备的医疗设备，科室拥有多种国际先进的美容激光系统，包括CO2超脉冲激光，双波长色素激光，Q开关翠绿宝石激光，半导体脱毛激光，脉冲染料激光，“王者风范”光子嫩肤系统，微晶磨削仪等。此外，专科还设有医学美容室，提供光子治疗后续服务以及常规面部美容护理等。