山西省第二人民医院擅长的科室有骨科、妇产科、普通外科、脑血管病科、血液科等。
1、骨科
山西省第二人民医院骨科始建于1995年，擅长骨关节、创伤及脊柱方面病种的诊断及治疗。骨科立足疾病治疗前沿，采用最先进的治疗理念指导临床实践，在对骨科疾病治疗的研究与探索中，结合骨科疾病临床治疗经验及科室完善的骨科治疗体系，开创出“阶梯式治疗理念”——无创、微创、手术治疗模式。
2、妇产科
山西省第二人民医院妇产科是以医疗、教学、科研为一体的专业科室，是山西省优秀爱婴医院之一。科室拥有微波治疗仪、红外线治疗仪、多功能心电监护仪、胎心监护仪等设备，不断引进新技术、新疗法，近年来能开展的技术项目主要为：妇科方面如阴道炎、外阴肿物、宫颈炎、子宫肌瘤等疾病的诊疗，能开展宫颈癌广泛切除手术、三角子宫切除术、卵巢巨大囊肿切除术、宫外孕急诊手术等；产科如产前检查、妊娠并发症及合并症的诊断治疗等。
3、普通外科
山西省第二人民医院普通外科承担外科患者的疾病救治工作。治疗范围包含有肝、胆、胰、胃肠、乳腺、甲状腺，血管外科、泌尿生殖系统、食管及肺肿瘤等多学科领域。近年来，已与省内及北京等地著名专家合作，成功开展了多种疑难杂手术，取得了满意的效果。
4、脑血管病科
山西省第二人民医院脑血管病科是集脑血管病治疗、康复、预防指导为一体的技术优势学科。拥有技术全面、服务周到的治疗、护理、康复队伍及血液磁极化治疗机，神经功能重建仪超，多功能康复器械等先进设备，在对脑梗死、脑出血、蛛网膜下腔出血、动脉硬化性脑瘫等疾病的治疗方面，采用中西医结合、针灸理疗、康复训练一系列行之有效的方法，具有明显效果，并积累了丰富的经验。
5、血液科
山西省第二人民医院血液科配备有先进的并达到国家级水平的真彩图象骨髓分析系统，能够对白血病、各类贫血等进行诊断，并可进行骨髓活检检查；层流床净化级别已达百级，可有效地对粒缺患者进行防护，大大降低了粒缺患者的感染率，使患者治愈率提高，并大大减低了患者的经济负担。目前主要开展的临床工作是对急性白血病、多发性骨髓瘤等疾病能够进行诊断及系统治疗；对一些疑难病例及重型再障等症给予抗淋巴细胞球蛋白治疗，并达到一定水平。
