南京肿瘤外科医院排名比较靠前的是南京医科大学第一附属医院、南京鼓楼医院、东南大学附属中大医院。
南京医科大学第一附属医院肿瘤科是省级重点专科，科研成果突出，个体化与微创肿瘤治疗特色鲜明。南京鼓楼医院肿瘤中心是国家临床重点专科，免疫与精准治疗国内领先，学术影响力顶尖。东南大学附属中大医院肿瘤科为省级重点专科，博士点单位，放化疗及靶向治疗体系完善。
1.南京医科大学第一附属医院 肿瘤科
南京医科大学第一附属医院肿瘤科为江苏省肿瘤学重点专科、江苏省肿瘤转化研究中心，拥有江苏省135重点实验室，是全国癌痛规范化治疗示范病房。科室以基因组学指导个体化治疗、肿瘤MDT会诊、微创消融、粒子植入、生物治疗、遗传性肿瘤咨询为特色，多篇成果发表于国际顶级期刊，荣获教育部自然科学一等奖等多项奖励，医教研综合实力省内领先。
2.南京鼓楼医院 肿瘤中心
南京鼓楼医院肿瘤中心是国家临床重点专科、国家癌症区域医疗中心共建单位，为江苏省首家肿瘤学博士培养单位，拥有南京大学临床肿瘤学研究所及博士后工作站。学科在免疫治疗、新抗原疫苗、精准放疗、纳米靶向、腹腔热灌注等领域国内领先，承担国家重点研发计划等60余项课题，是国内肿瘤个体化与免疫治疗的标杆学科。
3.东南大学附属中大医院 肿瘤科
东南大学附属中大医院肿瘤科为江苏省临床重点专科、肿瘤学博士学位授予点。科室聚焦恶性肿瘤分子靶向、消化道肿瘤诊疗及纳米医学研究，承担国家及省自然科学基金近十项，SCI累计影响因子超30分。科室配备直线加速器、热疗机等先进设备，常规开展规范化疗、精准放疗、分子靶向、内分泌治疗、热疗、中西医结合及心理支持治疗，为肿瘤患者提供全流程个体化综合诊疗服务。
4.南京市第一医院 肿瘤外科
南京市第一医院肿瘤外科是南京医科大学肿瘤中心临床基地、江苏省 “十三五科教工程” 医学重点学科，同时为全国肿瘤药物临床试验机构、国家级博士后科研工作站。科室整合多学科资源，采用循证医学指导下的规范、个体化及多学科综合治疗，依托沃森智能诊疗系统与分子标志检测，实现肿瘤精准治疗，疗效突出。
5. 南京市第二医院 肿瘤科
南京市第二医院肿瘤科致力于肿瘤个体化与综合治疗，开展基因组学指导下的精准诊疗、多种肿瘤免疫治疗及 TACE、射频消融等微创技术，拥有直线加速器等高精尖放疗设备，可开展三维适形放疗、调强适形放疗等先进技术。科室在肺癌、肝癌、宫颈癌等多种实体瘤治疗上经验丰富，擅长癌痛规范化治疗与营养支持，科研成果丰硕，获多项省市级医学新技术引进奖，主办国家级继续教育项目，在省内外具有较高影响力。
