北京大学第一医院擅长肾脏内科、泌尿外科、皮肤性病科、感染疾病科、风湿免疫科，这5个科室在复旦专科排行榜中名列前茅，建议患者根据自身的具体情况选择适合的科室就诊。
1、肾脏内科
由我国肾脏病事业的奠基人-王叔咸教授在50年代建立的全国第一个肾脏病专业和博士点，连续10年获得复旦肾脏病专科排行榜第1，先后被评为北京市重点学科及教育部国家重点学科，在国内外享有较高声誉。
2、泌尿外科
新中国泌尿外科事业的发源地和先行者，创始人是吴阶平院士，连续7年位列复旦泌尿外科专科排行榜的榜首，是高教部、教育部国家重点学科，也是卫生部临床重点学科。
3、皮肤性病科
迄今已有百年历史，名家辈出，是中国现代西医皮肤科的引领力量之一，连续多年位列复旦皮肤科专科榜前三，已成为国内一流、国际接轨的皮肤性病学医疗、教学与研究基地。
4、感染疾病科
复旦传染感染科专科排行第8，是国家感染病临床重点专科建设学科，国家肝病药物临床试验基地，主持多项国家“十一五”、“十二五”和“十三五”传染病重大专项课题。
5、风湿免疫科
国家皮肤与免疫疾病临床医学研究中心，国内首家启动并推广肌肉骨路超声标准化操作规范的单位，在2008年进入复旦风湿病专科排行榜单，多年来一直稳居前列。
除此之外，小儿内科、心血管病科、药剂科、全科医学科等专科也都具有非常丰富的临床经验，以及完备的检查、治疗体系，为常见和疑难罕见疾病患者提供高质量的诊疗服务。
