重庆消化内科比较厉害的三个医院是陆军军医大学第一附属医院、重庆医科大学附属第一医院、陆军军医大学新桥医院。
陆军军医大学第一附属医院消化科是国家重点培育学科、国家临床重点专科，内镜微创等技术国内领先，科研实力雄厚。重庆医科大学附属第一医院消化内科是市级消化疾病诊疗中心，内镜诊疗水平国内先进，西南地区率先开展多项特色技术。陆军军医大学新桥医院消化内科是博士硕士授权点，内镜培训实力突出，临床诊疗特色鲜明。
1、陆军军医大学第一附属医院 消化科
陆军军医大学第一附属医院消化科成立于1956年，是国家首批、全军最早的消化系病博士硕士授权点及博士后流动站，先后获评国家重点培育学科、国家临床重点专科、全军消化病研究所等多项荣誉。科室擅长内镜下微创诊治、中晚期肝病综合治疗等，牵头多项国家级课题，发表多篇高水平SCI论文，获国家科技进步奖等多项成果，国际合作密切。
2、重庆医科大学附属第一医院 消化内科
重庆医科大学附属第一医院消化内科创建于1957年，是博士硕士授权点、国家临床药理基地、重庆市消化疾病诊疗中心。科室内镜诊疗水平国内先进，西南地区率先开展ERCP、EUS-BD等多项特色技术，擅长急危重症及疑难病诊治，承担多项国家及省部级课题，获市级科技进步奖，学术及临床影响力位居西部领先。
3、陆军军医大学新桥医院 消化内科
陆军军医大学新桥医院消化内科始建于1952年，1978年成为硕士授权点，1991年获批博士授权点，2002年成立国内首家日本PENTAX内镜培训中心。科室聚焦胰腺疾病、慢性肝病等研究方向，常规开展多项内镜治疗技术，参与国家重点攻关课题，与国际知名学术机构有密切交流，教学成果突出，临床声誉良好。
4、重庆大坪医院 消化内科
重庆大坪医院消化内科综合水平居全军及重庆三甲医院领先地位，擅长诊治消化系统各类危急重症。科室在慢性肝病诊治、消化道早癌内镜诊疗、血管介入技术应用等方面特色鲜明，对脂肪肝、肝硬化、肝癌等肝病有系统研究，成功开展TIPS等多项特色技术，精准完成微小肝癌确诊及肝活检等诊疗工作，疗效显著。
5、重庆医科大学附属第二医院 消化内科
重庆医科大学附属第二医院消化内科是市级重点学科、临床重点专科，也是博士硕士授权点、博士后流动站及多项培训基地。科室食管胃静脉曲张内镜治疗水平重庆领先，擅长消化道早癌内镜诊疗、胆胰疾病微创治疗等，承担多项国家级及省部级课题，获多项科技进步奖，发表多篇高水平论文，综合实力位居西部前列。
