儿童肾病综合征医院比较好的是复旦大学附属儿科医院、首都医科大学附属北京儿童医院、重庆医科大学附属儿童医院，复旦大学附属儿科医院肾脏科是国内从事儿童肾脏疾病临床、科研和教学的重要基地之一，达上海第一、国内领先、国际先进水平。首都医科大学附属北京儿童医院肾病科收治各种急、慢性及疑难重症肾脏疾病患儿；重庆医科大学附属儿童医院肾脏内科是西南地区最大的儿童肾脏病诊治中心及儿童血液净化中心。
第一名：复旦大学附属儿科医院-肾脏科
复旦大学附属儿科医院肾脏科，是国内从事儿童肾脏疾病临床、科研和教学的重要基地之一。目前有自动腹膜透析机168台、血液透析机12台，达上海第一、国内领先、国际先进水平，相关研究内容先后获得“2014年度上海市科技进步奖”和中国儿科医学领域最具影响力的权威奖项之一“宋庆龄儿科医学奖”。在肾病综合征、肾炎等儿童常见肾病方面具有优势。
第二名：首都医科大学附属北京儿童医院-肾病科
首都医科大学附属北京儿童医院肾病科，收治包括肾病综合征、肾衰竭、肾小球肾炎等各种急、慢性及疑难重症肾脏疾病患儿。科室先后承担了国家“863”计划、“十一五”国家科技支撑计划、科技部、首发基金、中医药管理局、北京市级、北京市卫生计生委级等多部门的临床科研项目二十余项。参与完成多项国家级及省部级多项课题。
第三名：重庆医科大学附属儿童医院-肾脏内科
重庆医科大学附属儿童医院肾脏内科是西南地区最大的儿童肾脏病诊治中心及儿童血液净化中心。专科对难治性肾病、夜遗尿、肾病综合征、难治性尿路感染、急慢性肾炎、急慢性肾功能衰竭、继发性肾脏疾病的诊治达到国内先进水平。获得10项国家自然科学基金、省部级基金等项目资助，并获重庆市科技进步一等奖，中华医学科技三等奖等奖励多项。
第四名：浙江大学医学院附属儿童医院-肾内科
浙江大学医学院附属儿童医院肾内科，在各类难治性肾病综合征、紫癜性肾炎的治疗，以及蛋白尿发病机制的基础研究方面做出了突出的贡献，先后获得五项国家自然基金资助，获得浙江省政府科学技术二等奖一项，获浙江省医药卫生科技创新二等奖一项，发表各类科研论文近100篇，其中SCI论文20篇，为国内各省份培养博士研究生、硕士研究生多名。
第五名：上海交通大学医学院附属上海儿童医学中心-肾脏科
上海交通大学医学院附属上海儿童医学中心肾脏科，主要从事各种儿童肾脏疾病的临床医疗、教学和科研工作，包括肾病综合征、各种类型肾炎等。科室与美国著名的波士顿儿童医院、辛辛那提儿童医院肾脏科保持着密切的交流和合作关系，多名医师接受过中长期的境外专业培训，掌握本领域国际最新的发展动态和技术。