上海中医肾结石医院排名靠前的是上海中医药大学附属龙华医院、上海市中医医院、上海中医药大学附属曙光医院东院等，可就诊于肾内科。上海中医药大学附属龙华医院的肾内科为国家中医药管理局肾病重点专科；上海市中医医院肾内科系上海中医药大学“高峰高原学科”建设团队之一；上海中医药大学附属曙光医院东院肾病科运用中医、中西医结合治疗肾脏病积累了丰富的经验。
第一名：上海中医药大学附属龙华医院-肾内科
上海中医药大学附属龙华医院的肾内科，现已成为国家中医药管理局肾病重点专科、上海市中医特色专科（中医肾病专科）、上海中医药大学优势学科，在膜性肾病、IgA肾病、糖尿病肾病、狼疮性肾炎、急慢性尿路感染、慢性肾功能衰竭、肾结石等疾病的治疗上具有较好疗效，能开展血液透析、腹膜透析、结肠透析等各种技术。
第二名：上海市中医医院-肾内科
上海市中医医院肾内科系上海中医药大学“高峰高原学科”建设团队之一，由门诊、病房、血透室三部分组成。现有科内协定方剂6个、开设本专业的专病门诊4个，针对常见肾脏病常规开展了体外冲击波碎石术、动静脉内瘘成形术、肾穿刺活检术、血液透析长期导管置入等专科手术。初步形成了具有一定学术影响力的、中西医并举的、特色鲜明的专科。
第三名：上海中医药大学附属曙光医院东院-肾病科
上海中医药大学附属曙光医院东院肾病科运用中医、中西医结合治疗肾脏病有着悠久的历史，发挥中医特色，突出中医的优势，提出扶正泄浊、祛风胜湿等治疗方药取得较好的临床疗效，通过大量的临床和实验研究，总结其辨证论治的规律，积累了丰富的经验，诊疗范围包括肾炎、肾结石、肾衰竭等。
第四名：上海中医药大学附属曙光医院西院-肾病科
上海中医药大学附属曙光医院西院肾病科是全国最早成立的中医肾病专科之一，肾病科运用中医、中西医结合治疗肾脏病有着悠久的历史，2017年医院引进原第二军医大学附属长征医院肾脏科和解放军肾病科研究所教授、主任医师，拓展了肾炎、肾结石等肾脏病的西医治疗理念和西医先进技术，合理应用各种免疫抑制剂（特别是钙调磷酸酶抑制剂）治疗各种难治性肾病综合征，协同中医治疗减少药物副作用。
第五名：上海交通大学医学院附属瑞金医院-中医科
上海交通大学医学院附属瑞金医院中医科是上海市综合性医院示范中医科，开设了老年病、肿瘤、消化疾病、免疫性疾病、肾病、肝病、血液病等特色专家专病门诊，针对肾结石的临床疗效显著，并开发出有效的院内制剂，在医教研方面都取得了很好的成绩，在综合性医院中医临床医疗领域具有领先地位。
第六名：复旦大学附属中山医院-中医科
复旦大学附属中山医院中医科是国家临床重点专科、国家中医药管理局重点专科，是国家药物临床试验机构（中医神经、中医肿瘤）、国家中医药管理局神经生理病理三级实验室，也是全国综合医院中医药工作示范单位挂靠单位。开设胃炎、哮喘、糖尿病、肾结石等专病门诊，年门诊人次居上海同类专业首位。
第七名：上海交通大学医学院附属仁济医院-中医科
上海交通大学医学院附属仁济医院中医科是一个技术力量雄厚、医疗功底扎实的中医临床学科，是浦东新区中医“名科”、国家级名老中医工作室、上海针灸流派特色技术传承基地。设有哮喘、肾病、中医妇科等亚专业，方便肾结石患者就诊。科室医、教、研综合水平在全国中医科界达到领先水平。
第八名：上海交通大学医学院附属第九人民医院-中医科
上海交通大学医学院附属第九人民医院中医科设有四个临床分科和四个专病专科，在临床工作中，科室始终坚持发展中医特色，针药结合，并重视中西医疗法并用等原则，采用综合治疗方式为肾结石患者提供最优质的医疗服务。主编教材2部，其中《中医口腔科学》获得上海交通大学医学院教材建设二等奖，《中医学》获得上海交大医学院优秀教材二等奖、上海市教委颁发的优秀教材奖。
第九名：上海市第六人民医院-中医科
上海第六人民医院中医科为国家药品监督管理局中医脑病新药临床试验资格认定单位，是上海市综合性医院示范中医科。设有亚学科中医内科、中医肛肠科及中医妇科等，在治疗常见病、多发病和疑难杂症以及肿瘤的中医药治疗等方面也积累了丰富的经验。对补肾活血法治疗慢性肾功能不全、泄热化滞法治疗胆石症、三金排石汤治疗肾结石等方面，均有着较好的临床效果。
第十名：上海长海医院-中医内科
上海长海医院中医内科为国家中医药管理局中医内科重点学科，拥有中西医结合临床博士学位授予点、中医内科学硕士学位授予点。科室是一个以教学为主，教、医、研三位一体的学科。在治疗方式上，除了传统的汤剂给药，辅以膏滋、中药外洗、穴位敷贴、食疗、茶饮、灌肠等多种治疗手段，诊治肾脏常见病症，如肾结石、肾炎、肾功能不全等。