哈尔滨医科大学附属第四医院擅长感染科、呼吸内科、泌尿外科、医学影像科等。这些科室设备齐全、技术力量雄厚，可以为患者提供高水平的治疗。
1、感染科
哈尔滨医科大学附属第四医院感染科是省重点专科，是首批获得批准的国家卫生部专科医师规范化培训基地。2013创立了全省首家乙肝母婴阻断门诊，接诊感染乙肝病毒的孕妇数千余人次，阻断成功率99.8%。是首批加入全国乙肝母婴零传播工程的单位之一。承担国家、省、市多项科研项目。
2、呼吸内科
哈尔滨医科大学附属第四医院呼吸内科，是省重点专科。科室呼吸危重症的治疗呼吸危重症与内科危重症并举，覆盖呼吸、循环、肝、肾、胃肠、出凝血、营养免疫及神经精神等各器官系统功能障碍的诊断、监测及支持/替代。着重突出呼吸危重症患者全程序贯治疗及康复。呼吸疑难病的诊治对呼吸科的疑难病、少见病有较高的诊疗水平，对于不明原因发热、肺部空洞性病变、全身系统性疾病及恶性疾病侵袭肺脏等各类疑难少见病有较高的诊疗能力。
3、泌尿外科
哈尔滨医科大学附属第四医院泌尿外科是省重点专科，连续多年荣获哈医大四院“先进医疗科室”。在省内率先引进了达·芬奇第四代机器人，目前已经开展了几乎所有泌尿系统疾病微创手术治疗，如：成功地实施了省内首例机器人辅助腹腔镜下膀胱癌根治术，在省内首次开展机器人辅助腹腔镜解剖性前列腺癌根治术。输尿管软镜下钬激光治疗肾及输尿管结石例数为省内之首，省内率先开展经尿道钬激光前列腺剜除术。
4、医学影像科
哈尔滨医科大学附属第四医院医学影像科是国家临床重点建设专科，影像中心下设CT室、磁共振室及普通放射科，医疗设备先进。医学影像专业水平处在国内外医学影像学研究发展的前沿，突出“专科发展”与“一专多能”相结合的发展模式、创建具有自身特色的“综合影像”管理体制，在影像诊断上做到既全面又精确的要求。