新疆中医科医院排名比较靠前的是乌鲁木齐市中医医院、新疆维吾尔自治区人民医院、新疆医科大学第一附属医院。
乌鲁木齐市中医医院中医科医师职称结构优良，对多种中医内科、妇科、男科疾病诊疗优势突出。新疆维吾尔自治区人民医院中医科是全国综合性医院中医示范单位，中医综合诊疗与康复体系完善。新疆医科大学第一附属医院中医科科研教学实力突出，中西医结合慢病康复诊疗水平领先。
1.乌鲁木齐市中医医院 中医科
乌鲁木齐市中医医院中医科由临床经验丰富的主治医师以上职称人员组成，擅长中医科常见病、多发病及疑难病诊治，在便秘、月经不调、乳腺炎、乳腺增生、闭经、不孕不育、前列腺炎、前列腺增生等病症治疗上效果显著，坚持中医辨证施治原则，为患者提供规范且针对性强的中医诊疗服务。
2.新疆维吾尔自治区人民医院 中医科
新疆维吾尔自治区人民医院中医科是集医疗、教学、科研、预防、康复、保健于一体的综合性科室，荣获全国综合性医院中医示范单位称号。科室运用中药、针刺、艾灸、拔罐、中药熏蒸等多种中医特色疗法，在颈腰椎病、冠心病、糖尿病、风湿免疫疾病等方面形成成熟方案，同时开展术后康复与中医特色保健服务，综合诊疗能力位居全疆前列。
3.新疆医科大学第一附属医院 中医科
新疆医科大学第一附属医院中医科是集医疗、科研、教学于一体的临床一级学科，承担高校教学及全疆中西医进修人员培训工作。科室以心脑血管疾病、血液病、风湿、内分泌及老年慢病康复为特色，开展中药膏方及各类中医外治疗法，承担多项省部级科研项目，发表多篇学术论文并获自治区优秀论文奖，诊疗水平居全疆综合医院中医科前列。
4.新疆维吾尔自治区中医医院 内科
新疆维吾尔自治区中医医院内科由经验丰富的主治医师以上职称人员组成，熟练开展内科常见病、多发病及疑难病诊治，在胆囊炎、胰腺炎、消化吸收不良、上消化道出血、腹膜炎、阑尾炎等消化系统疾病治疗上优势明显，依托中医理论制定个体化诊疗方案，为内科患者提供稳定可靠的中医药诊疗服务。
5.新疆医科大学第二附属医院 中医科
新疆医科大学第二附属医院中医科是全疆综合医院首批成立的中医科室之一，设有全国名中医传承工作室，以中西医结合双重诊断治疗为特色。科室开展针刺、艾灸、穴位埋线、中药热奄包等多项中医特色疗法，擅长内科杂病、颈腰椎病、睡眠障碍、不孕不育及恶性肿瘤辅助治疗，门诊中医治疗率高，可为各类患者提供全方位中医药诊疗服务。
