细菌性痢疾建议就诊于消化科，新疆治疗细菌性痢疾医院排名靠前的是新疆维吾尔自治区人民医院消化科、新疆医科大学第一附属医院消化科、新疆医科大学第二附属医院消化内科。新疆维吾尔自治区人民医院消化科是全疆首批重点专科，综合实力全疆首屈一指；新疆医科大学第一附属医院消化科内镜技术起步早，多项技术居疆内领先；新疆医科大学第二附属医院消化内科历史悠久，疑难重症诊治经验丰富。
1、新疆维吾尔自治区人民医院 消化科
新疆维吾尔自治区人民医院消化科是全疆首批消化重点专科、新疆消化病诊疗质量控制中心主任单位，中华医学会消化内镜培训中心新疆培训基地。内镜中心规模全疆最大，在西北五省率先引进胶囊内镜，开展ESD、POEM等国际先进内镜手术，建立新疆消化道早癌联盟，获多项自治区科技进步奖，是全疆消化领域医教研中心。
2、新疆医科大学第一附属医院 消化科
新疆医科大学第一附属医院消化科是自治区级住院医师培训基地、硕士学位授予单位。1979年在全国率先开展ERCP，1996年在新疆率先开展内镜下胆总管结石取石术，内镜诊治水平居疆内一流。承担国家及自治区级科研课题，获自治区科技进步奖，发表多篇SCI及核心论文，兼具医疗、教学、科研综合实力。
3、新疆医科大学第二附属医院 消化内科
新疆医科大学第二附属医院消化内科是国家药物临床试验消化专业认证科室、新疆消化病学专科联盟常务理事单位。分胃肠、肝胆两大病区，在细菌性痢疾、消化道出血、重症胰腺炎、肝硬化等危重症抢救方面能力突出，开展多种介入治疗技术，常年邀请国内知名专家坐诊指导，医教研协同发展。
4、新疆医科大学第五附属医院 消化内科
新疆医科大学第五附属医院消化内科是现代化消化系统疾病诊疗中心，开设胃食管反流病专病门诊，内镜中心设备齐全。熟练开展ESD、POEM、ERCP等各类内镜诊疗技术，可精准诊治胃肠道肿瘤、炎症性肠病等疑难疾病，急诊内镜诊疗经验丰富，将国内外新技术广泛应用于临床，诊疗优势显著。
5、新疆阿克苏地区第一人民医院 消化内科
新疆阿克苏地区第一人民医院消化内科，汇聚一批主治医师以上职称、临床经验丰富的专业医务人员。擅长消化内科各类常见病、多发病及疑难病的诊治，尤其在胃炎、消化性溃疡、消化道肿瘤、肝硬化、胰腺炎、细菌性痢疾等疾病治疗方面形成显著优势，诊疗规范、技术扎实，为区域群众消化系统健康保驾护航。
