安徽省精神卫生中心擅长儿少精神心理科、临床心理学科、焦虑抑郁科、睡眠障碍科、老年心理科。上述科室学科综合实力领先，临床专科诊治优势突出，能够为患者提供优质的医疗服务。
1、儿少精神心理科
目前科室已发展成为集医疗、教学、科研为一体的儿童青少年心理卫生专业机构，为省内外儿童青少年精神、心理障碍患者提供科学、专业、多样化的诊疗服务。学科在省内一直处于领先地位，在国内也享有较高声誉。
2、临床心理学科
影响力辐射省内外，其中儿童情绪障碍的神经心理评估、青少年精神分裂症心理干预、行为与催眠治疗、家庭治疗、儿童青少年精神疾病的团体康复治疗等技术在全省乃至全国处于领先水平。
3、焦虑抑郁科
是安徽省最早、最大的焦虑抑郁专科，也是全国最早开设的开放性病房。擅长广泛性焦虑、惊恐障碍、恐怖症、强迫症、躯体形式障碍及神经衰弱等；各种抑郁症及部分心境障碍等的诊治。
4、睡眠障碍科
是省内首个开设睡眠障碍科的精神医学诊疗机构。针对睡眠—觉醒障碍、心身障碍、焦虑、抑郁、失眠伴有 多种躯体不适的患者进行综合性治疗，极具专科特色，临床经验丰富。
5、老年心理科
是该省最早设立的专业老年精神医学诊疗机构。拥有阿尔茨海默病治疗仪及脑循环治疗等设备，有效促进精神康复、恢复躯体功能。尤其在老年期抑郁症及痴呆的早期识别和治疗具有丰富经验。