新疆消化科医院排名靠前的是新疆维吾尔自治区人民医院消化科、新疆医科大学第一附属医院消化科、新疆维吾尔自治区中医医院消化内科等，新疆维吾尔自治区人民医院消化科是新疆消化病学专业委员会主任委员单位、全疆首批消化重点专科，也是新疆地区首屈一指的消化系统疾病医疗、科研和教学中心；新疆医科大学第一附属医院消化科是自治区级重点学科内科学主要支撑科室之一，消化内镜诊疗技术处于疆内领先地位；新疆维吾尔自治区中医医院消化内科是具备鲜明中西医结合特色的消化疾病诊疗科室，拥有疆内先进水平的内镜设备及多元诊疗手段。
1、新疆维吾尔自治区人民医院 消化科
该科室1985年由大内科分出独立成科，是新疆消化病学专业委员会主任委员单位、2013年全疆首批消化重点专科、2016年新疆消化病诊疗质量控制中心主任单位，拥有中华医学会消化内镜培训中心新疆培训基地等多个国家级、自治区级培训基地资质。科室设消化病房、内镜治疗中心、实验中心3个中心，开放床位100张，年出院患者5000人次以上，内镜中心占地面积2500平方米，年诊治患者超4万人次，规模居全疆首位，现有享受国务院政府特殊津贴专家1名，科研方面主持自治区级以上科研项目10项，获自治区科技进步二等奖1项、三等奖4项，年发表论文50篇以上，消化道早癌诊疗等特色技术达国内先进水平。
2、新疆医科大学第一附属医院 消化科
该科室1977年从大内科分离独立设科，是自治区级住院医师培训基地、专业型和科学型硕士学位授予单位，也是自治区级重点学科内科学主要支撑科室之一，医疗方面近三年年均门诊13379人次、年出院1671人次，2002年率先在疆内组建集中管理的内镜中心，消化内镜年诊治量超20000人次。科室1979年在全国率先开展内窥镜下逆行胰胆管造影术，1996年在新疆率先开展胆总管结石内镜取石术，目前可开展ESD、POEM等内镜技术，处于疆内领先地位。科研方面获国家自然科学基金2项，近五年发表SCI论文3篇、核心期刊论文近30篇。
3、新疆维吾尔自治区中医医院 消化内科
该科室学科带头人徐杰主任担任中华中医药学会脾胃病分会常委、中国中西医结合学会消化内镜专业委员会常委等多个国家级及自治区级学术职务。科室现有全国名老中医学术继承人2名，配备OlympusCV-290型电子胃肠镜、超声胃镜等疆内先进水平设备，形成鲜明的中西医结合诊疗特色：中医方面开展中药热包、直肠滴入、艾灸、穴位贴敷等特色疗法；西医方面可开展ESD、STER、POEM、ERCP取石等内镜技术，擅长急慢性胃炎、消化道肿瘤、炎症性肠病等消化系统疾病诊疗。
4、新疆医科大学第二附属医院 消化内科
该科室自1954年建院即成立，是国家药物临床试验消化专业认证科室、新疆医科大学第二附属医院重点培育科室，获评新疆消化病学专科联盟常务理事单位、自治区食管疾病规范治疗联盟副组长单位。科室分胃肠、肝胆两个病区，常年邀请上海知名三甲医院消化科专家担任业务顾问参与查房坐诊。科室擅长急重症胰腺炎、炎症性肠病、肝硬化并发症等疾病诊疗，可开展实体瘤介入、胆道支架置入等技术，对上消化道大出血、重症肝炎等危急重症的抢救能力突出。
5、新疆医科大学第五附属医院 消化内科
该科室是集医疗、教学、科研于一体的现代化消化系统疾病诊疗中心，设有消化普通/专家门诊、胃食管反流病专科门诊及内镜中心，配备电子胃肠镜、超声内镜、胶囊内镜等数十台内镜设备，及射频治疗仪、氩气电凝电切仪等治疗设备。科室可开展EMR、ESD、POEM、ERCP、EUS-FNA等多种内镜诊疗技术，娴熟开展急诊胃肠镜及镜下治疗，对消化性溃疡、肝硬化、炎症性肠病等各类复杂疑难消化疾病诊疗经验丰富，胃食管反流病专病诊疗特色鲜明。
