厦门长庚医院消化内科设有内视镜检查室二间，主要开展腹痛、胃溃疡、黑色便、血便、大便习惯改变、食欲不振、胃酸、十二指肠溃疡、吐血、吞咽困难、皮肤黄染、甲乙肝炎带原体测定、肝机能异常、肝胆结石、肝硬化等诊疗项目。