巨野县人民医院始建于1949年，经过一代又一代人的努力，医院规模不断扩大，医疗技术水平不断提高，已经发展成为一所集医疗、教学、科研、康养、保健、急诊急救服务为一体的综合医院和爱婴医院。

医院于2021年6月整体搬迁至新院区，开启了一院二区新模式（新院区位于青年路西段6456号，老院区位于文化路3号）医院占地面积173亩，总建筑面积14.19万平方米，开放床位1200张。核定编制人员数为1800人，现有职工1652人。高级职称人员314人（其中正高级职称52人，副高级职称262人），中级职称690人，博士生1人，硕士研究73人。设有临床科室41个、医技科室 12个，职能后勤科室29个。

拥有县域省级临床重点专科1个（骨科），省级优质护理服务科室1个（ICU），市级医疗质量示范科室1个(神经内科)，市级临床重点专科11个（心内科、神经内科、普通外科、骨科、泌尿外科、儿科、麻醉科、产科、重症医学科、神经外科、呼吸内科）、市级医学重点学科2个（ICU、检验科）。

医院始终坚持“以病人为中心，以质量为核心”的管理理念，积极构建学习型、节约型、和谐型医院。建立了急危重症孕产妇救治中心、急危重症新生儿救治中心、国家级胸痛中心、省级卒中中心等，先后与北京大学人民医院、山东大学齐鲁医院、山东大学第二医院等建立了密切技术协作关系，培养了大批优秀专业人才，逐步形成了“院有优势、科有特色、人具专长”的良好局面。能开展颈腰针灸微创治疗术、智能定靶碎石机治疗各类结石、输尿管软镜+钬激光术、冠状动脉支架植入术、关节镜下治疗臀肌挛缩症微创术、肿块穿刺活检术、微波消融术、尿道中段无张力悬吊术、关节镜下治疗肌性斜颈微创术、腹腔镜关节镜下治疗腕管综合征微创技术、 PFBN固定治疗股骨转子间骨折术、脑血管畸形复合术、腹腔镜下巨大肝血管瘤切除术、ERCP技术、单孔胸腔镜技术、VSD负压引流技术、髋膝关节微创置换术、钬激光剜除术、急性上消化道出血急诊胃镜止血术等，充分彰显了医院综合技术水平。配备有1.5T/3.0T核磁共振、双源CT、螺旋CT，数字胃肠机、医用计算机影像。系统、钼靶、全自动生化分析仪等大中型医疗仪器400余台（套）。

医院先后获得“全国十佳百姓放心医院”“国家节约型公共机构示范单位”“国家综合防治卒中中心单位”“国家PCCM科学规范化建设优秀单位”“中国红十字会公益先锋岗”“山东省医院管理先进集体”“山东省首批医患和谐示范医院”“国家乙肝临床治愈门诊规范化建设与能力提升培育单位”“国家骨质疏松筛查与规范治疗能力建设项目骨质疏松预防门诊”“县域医院院长大会服务创新卓越奖等称号。