复旦大学附属肿瘤医院胸外科，组建时间：1983年，胸外科独立分科始于1983年。2000年6月，上海肿瘤医院新大楼启用后，原胸外科分为胸外及乳腺两科。科室集医、教、研于一体，以肺、食管恶性肿瘤的临床诊治为重点，同时积极开展对于纵隔肿瘤、胸壁、胸膜及软组织肿瘤的临床诊治及科研工作。1973年起，由谢大业教授在国内首创应用冷冻疗法治疗转移性肺癌及部分周围型肺癌，在达到病灶局控的基础上，大大缩小了肺组织及功能的损伤，提高了患者术后的生活质量。尤其对于部分肺内多发转移的病人，由此得到了手术治疗及缓解病情的机会。至今该方法已治疗转移性肺癌病例150例以上，取得了良好的疗效，曾获得“上海市卫生局科技三等奖”和法国“第三世界科技进步奖”。

同时，上海肿瘤医院胸外科还在全国范围内较早开展了“颈部食管癌全喉、全食管切除术”，改变了以往颈部食管癌只能依靠放射治疗的局限，至今已成功治疗了20余例患者。2000年3月以来，在国内较早开展了胸段食管癌三野淋巴结清扫根治术，严格按照国际标准，采用颈、胸、腹三区域淋巴结清扫加全食管切除、胃代食管颈部吻合的方法。与现今国内普遍采用的传统手术方法相比，该方法虽然因手术范围的扩大而增加了围手术期的并发症及死亡率，但合理地扩大手术范围，既保证了足够的手术切缘，又能较精确地提供病灶周围及区域淋巴结转移情况，准确指导术后的综合治疗，从而在整体上提高了病灶局控率及患者的术后生存率。至今经该方法治疗的患者已达300余例，通过全体医务人员的努力，“三野清扫根治术”成功地达到了围手术期的“0”死亡率(术后30天内)，术后并发症的发生率也被控制在较低的范围内。2001年，上海肿瘤医院胸外科借助医院原有放射诊断及病理优势，开展了“CT定位经皮肺穿刺活检术”，使部分常规检查难以确诊的病例能在术前得到较为明确的病理诊断，从而有效指导治疗方案的制订。

上海肿瘤医院胸外科科室规模由原先的56张发展到91张床位，医护人员29名，其中医师16名，护理人员13名。医师：教授5名，副教授5名，主治医师1名，住院医师5名。护理人员：主管护师1名，护师4名，普通护士13名。手术量从2006年的500台增加到2012年的2580台，手术并发症发生率逐年下降，各项医疗指标均达到国际先进水平。专家门诊：15400人次/年。

科研方面，建立形成了肺癌分子分型和个体化治疗的特色体系和实验平台。近五年取得六项国家自然科学基金，有关“肺腺癌分子生物标志的转化性研究” 荣获上海市科技进步二等奖。在JCO、CCR、Cancer、JTCVS、Annals of Thoracic Surgery等学术期刊上发表SCI收录论文四十余篇，影响因子IF总值达221.411，其中18分以上的4篇，5分以上6篇。尤其2010年发表在Journal of Clinical Oncology(IF=18.98)有关“东亚不吸烟肺腺癌分子分型”研究被评为JCO杂志年度Top50（J Clin Oncol, 2010, 28: 4616-20）；2012年所发表在Clinial Cancer Research（IF=7.33）有关“肺癌ALK融合基因检测”研究（Clin Cancer Res. 2012, 18:4725-32）被Cancer Research专门刊文进行报道（Cancer Res, 2012, 72:4287）誉为“突破性进展Breaking Advances”，同年该研究还被美国胸科医师学院授予阿尔弗雷德索弗研究奖Alfred Soffer Research Award；我们同时还是全球首先发现肺癌RET融合基因的团队之一，2012年有关“肺癌RET融合基因的研究”再次收入Journal of Clinical Oncology（J Clin Oncol. 2012, 30:4352-9），编辑部同期配发Editorial进行深入解读（J Clin Oncol. 2012, 30:4439-41）。