中国藏学研究中心北京藏医院(暨北京民族医院)始建于1992年，由中国藏学研究中心和西藏自治区山南地区行署联合创建。1998年经中央统战部、国家民委、国家中医药管理局联合发文，决定把北京藏医院扩建为一所“以藏医为主，多民族医为一体，民族医、中西医结合、医教研结合的国家级民族医疗机构”，并于2000年在亚运村异地扩建，2002年竣工迁入现址。

北京藏医院建院以来，在中央统战部、国家民委、国家中医药管理局等各部委局的关怀与指导下，不断发展壮大。目前医院占地面积22亩，建筑面积1.2万平方米，开放床位100张，开设藏、中、西医8个临床科室，10个医技科室和4个住院病区。其中藏医心脑病科、藏医胃肠病科为特色专科，藏药浴科为国家中医药管理局重点专科。医院配有现代化的诊疗设备，包括进口MRI、全数字化X线摄像系统、多层螺旋CT、彩色B超、全自动生化分析仪等。同时医院已启动PCR实验室，为患者提供优质的医疗服务。

北京藏医院在建设与发展中，注重临床、科研和教学紧密结合，充分利用首都的科技与人才优势，不断提升民族医药内涵，并与国内外十几家科研机构建立了协作关系，在藏医临床研究、文献研究、藏药研究、藏医医技医法抢救与整理方面成果显著。已完成科技部国家科技支撑项目及中国藏学研究中心等部级项目数十项，2项科研成果已获得国家专利，发表民族医药专业论文数百篇、专著十余部，目前正在稳步推进财政部项目“藏医心脑血管临床和民族医技医法传承及新药开发研究”。完成北京市名老藏医药专家师带徒工作，连续举办十一届“全国藏医药高级研修班”和数届国际藏医药培训班。我院是成都中医药大学、青海大学藏医学院、西藏藏医药大学的教学实习医院，中国民族医药协会、北京市中医协会副会长单位，中国民族医药协会医师分会会长单位，国家级继续教育基地、中医药国际合作基地和国家自然科学基金委托申报单位。我院于2021年与山南市藏医医院和西藏甘露藏药产业集团分别签订合作协议，成立了藏医医联体和西藏藏医药产业科技创新联盟，促进了藏医药事业发展和繁荣，服务健康中国战略。

北京藏医院秉承“继承、创新、和谐、精诚”的院训，发挥自身地处北京的区位和行业优势，推动藏医药和民族医药的挖掘传承和研究创新，服务首都各民族群众，服务西藏及涉藏重点省。致力于为政府提供政策性建议、推动民族医药法制化进程，已经成为落实民族政策、传承和发展民族优秀文化、培育人才的重要平台。