鄯善县维吾尔医医院成立于1983年，是我县唯一一家以中医、维吾尔医药治疗为主、中西并重，集医疗、科研、教学、保健、康复、康养为一体的“二级甲等”民族医医院。医院占地面积46亩，目前有医疗用房建筑面积9155平米，紧邻沙山公园，环境优美。医院始终秉承“诚信、仁爱、敬业、进取”的医院精神，遵循“诚心、仁爱、谦和、精博”的院训，以“人才立院、科技强院、专科兴院”为发展战略，始终注重文化建设，努力打造学习型医院，以精湛的技术、崭新的风貌，优质的服务，真正做到让百姓满意的特色医院。
截至2021年8月，医院编制床位95张，实际开放床位数250张。医院有工作人员274人，少数民族职工有259人，汉族职工有15人，占总人数的6%.其中：专业技术人员206人，占职工总人数的75%；工勤人员及其他23人，占职工总人数的8%.高级专业技术人员27人、占专业技术人员13%，中级专业技术人员10人、占专业技术人员5%，本科学历46人、占全院职工17%，大专学历126人，占全院职工46%，中专及以下学历101人，占全院职工37%.临床护士100人，与床位之比为0.4：1(国家标准要求>0. 4:1)。
现设有临床科室7个：门诊部、康复医学科、骨科、妇科、内科、中医科、治未病科。其中，康复科、骨科为医院重点建设专科。
医技科室7个：药剂科、合剂室、功能科、检验科、放射科、手麻科、理疗科、供应室、体检科、预防保健科、病案室。
职能科室12 个：党政办、医务部、护理部、财务科、效能办、院感科、人事科、设备科、采购办、宣传科、信息科、公共卫生科、总务科、保卫科。
医院拥有菲利普16 排全身螺旋 CT、四维彩超、DR、全自动生化分析仪、麻醉机、口腔综合治疗仪、口腔X线机、动态心电图机、电子阴道镜、LEEF 刀、腹腔镜、骨科显微镜、白象低温等离子消毒机、脉动蒸汽锅、血气分析仪、全自动电解质分析仪、红蓝光治疗仪、阴道五联检、无创呼吸机、半自动血细胞分析仪、高尔宝尿十一项分析仪、全自动血沉分析仪、特康8510全自动五分类血细胞分析仪、博唐平全自动四通道糖化血红蛋白监测仪、C型臂、(双通道)中低频治疗仪、养生光波房、玉玄宫电磁治疗仪、血液细胞分析仪、离心机、冷喷机、脱色摇床、AH-600超声手术系统、妇科宫腔镜一套、深层肌肉刺激仪、综合性妇科检查床、纯水机等，设备总值2000余万元。
目前我院医院规模、科室设置、人员结构、设备设施等相关指标均已达到二级甲等民族医医院标准要求。
2017年同乌鲁木齐友谊医院建立了医联体技术协作医院，并根据我院维吾尔医医院临床课题及科研项目的实际，前后选派8名医护人员赴乌鲁木齐友谊医院进修学习，进一步推动我院中医民族医药事业高质量发展。
2018年9月先后与各乡镇卫生院签订“医共体”合作协议，共同构建“维吾尔医专科联盟协作医院”，充分发挥自身民族医药优势特点，在人才培养、技术支持、科研创新等方面开展深度合作，实现资源共享、优势互补、共同发展，为全县广大患者提供更为优质的医疗服务，切实解决人民群众看病就医问题，真正实现百姓看病难不再难。加强与基层协作，推广中医民族医适宜技术，互促共赢。同县域内所有乡、镇卫生院建立维吾尔医专科联盟关系，对“中药煎药”、“针灸理疗”等中医民族医适宜技术推广；实行双向转诊，提高住院率和病床使用率。