龙岩市第二医院前身为1898年在厦门鼓浪屿创办的救世医院，后改名为厦门鼓浪屿医院。1970年3月迁往龙岩，改称福建生产建设兵团一师医院，1974年改为福建生产建设兵团龙岩煤矿医院，1975年更名为龙岩地区煤矿医院，1977年由龙岩地区行政公署接管，改名为龙岩地区第二医院。1997年5月1日，龙岩撤地建市，医院随之更名为龙岩市第二医院。几经更迭迄今，历经百年沧桑，现已发展成为一所集医疗、教学、科研、预防保健为一体的大型三甲综合医院，承担着闽西及粤北赣南等周边地区人民的医疗健康任务。医院编制床位1250张，开放床位1580张，设有临床和医技科室62个，在职职工1785人，其中卫生专业技术人员1584人。现有高级专业人才357人，医学博、硕士166人。龙岩市传染病医院、龙岩市肿瘤医院、龙岩市肿瘤研究所、龙岩市互联网医院挂靠我院。

医院实施一院四区的布局，形成了以院本部发展建设为主体，东院区、锦山门诊部、南部新城分院(坎市医院)四个院区并行发展的“一体三翼”发展格局。与中山大学孙逸仙纪念医院、天津市眼科医院、福建医科大学附属第二医院建立协作帮扶关系，“三驾马车”齐驱并驾，培育一批在医疗技术、医疗质量、临床研究等方面具有闽西乃至福建一流水平的优势专科，推动医院高质量发展。

肿瘤科、普外科、泌尿外科、中医肝病科为省级临床重点专科；骨科、肿瘤科、肝胆外科、泌尿外科、妇科、呼吸内科、消化内科、神经内科、感染科、医学影像学、重症医学科、眼科、康复科等13个学科为市级临床医学重点专科。泌尿外科、肝胆外科、妇科、胃肠外科、胸外科、乳腺科等微创外科技术在全市开展最早、手术最多，技术领先，多项技术填补全市空白。其中，泌尿外科率先在全国开展五通道无管化经皮肾碎石取石术，且多项技术在全省领先，部分达到国内先进水平。肿瘤早期诊治、微创手术治疗、肿瘤放化疗、中医中药综合治疗，达到省内先进水平。眼科系国家卫健委“健康快车”定点医院，全省唯一的糖尿病视网膜病变筛查中心。神经内科在国内TCD行内首创“LP标识法”，成为全国行业标准；开展的发泡试验检测技术全国知名、全省领先；主编《发泡试验的操作方法及临床应用》，获国家发明专利、省部级科技奖三等奖报道了全球首例卒中样发病的神经元核内包涵体病。

医院拥有一流的诊疗设备。有Sinemens高端双源螺旋CT、Sinemens3.0T核磁共振、直线加速器、Discovery CT590RT电子计算机放疗模拟定位系统、BSD2000深部肿瘤热疗系统、ECT、Innova 3100-IQ数字减影血管造影系统、3D腹腔镜摄像系统、Cios Alpha-C臂机、BIPLAR500e-G臂机、双波长激光治疗系统、氩氦冷冻消融设备、超声内镜、全省第一台法国光太多点眼底激光，全省第二台德国海德堡激光眼底成像仪等先进医疗设备。配备了全国先进的全自动流水线检验系统；全省第一套智能化轨道物流；全省先进的腔镜一体化手术室；移动方舱检测实验室；移动CT车等共计5.74亿元医疗设备。

近年来医院医疗服务能力显著提升，病人满意度连年位居全省前列，被中央文明委评为第六届全国文明单位。