医院始建于1951年，是一所集医疗、教学、科研、预防、保健、急救为一体的区域医疗中心，承担着门头沟区40万人口的基本医疗服务，是区级急诊、护理、病案、检验、口腔质控中心。1994年获得“爱婴医院”称号，1996年通过“二级甲等医院”评审。2018年11月正式成为首都医科大学门头沟教学医院。2019年12月成为国家级“示范防治卒中中心”，同月通过中国胸痛中心标准版认证并获得授牌。2021年9月和11月分别通过了医院电子病历四级和互联互通四级乙等的全部评审评测工作，提前达到了三级医院信息化建设要求。

区医院以常见病、多发病的精益诊治，开展专业高效的医疗业务，已形成了脊柱和关节微创外科、心血管疾病治疗、消化内镜下诊疗、肿瘤和外周血管介入治疗等为特色品牌的全新技术格局。十三五期间，医院成立“五大中心”(胸痛、卒中、创伤、危重孕产妇抢救和肿瘤中心)形成多学科诊疗协作模式。其中：骨科、普通外科、心血管内科、肿瘤与介入科、妇产科、急诊科、ICU、神经外科、神经内科和健康管理中心为区级重点学科。十四五开局两年，在加强泌尿外科、骨科中心、肿瘤科三个优势学科建设的基础上，逐步培育形成普通外科、妇科专病中心、康复医学科、消化内镜中心、慢病管理中心(MMC)等一批潜在优势学科群。

为贯彻落实全国卫生与健康大会精神，深化医改和公立医院综合改革，推动北京市优质医疗资源下沉，应门头沟区委、区政府邀请，首都医科大学附属北京同仁医院与门头沟区政府签署合作协议，自2024年1月起，由北京同仁医院委托管理门头沟区医院，加挂“首都医科大学附属北京同仁医院门头沟医院”牌匾。

首都医科大学附属北京同仁医院始建于1886年，是一所以眼科学、耳鼻咽喉科学为教育部国家重点学科的大型综合三甲医院。医院以综合医疗为主体，北京市眼科研究所、北京市耳鼻咽喉科研究所、北京市糖尿病研究所为附属科研机构，形成“一院三所”发展格局，成为集医疗、教学、科研、预防、国际交流五位一体的医疗科研联合体。眼科、耳鼻咽喉科、变态反应(鼻过敏)科为国家临床重点专科，中医眼科学为国家级中医重点学科。

医院以综合医疗为主体，附设北京市眼科研究所、耳鼻咽喉科研究所、糖尿病研究所，形成“一院三所”发展格局。8个省部级重点实验室，7个国家及省部级工程研究中心，2个省部级科技合作基地，设有世界卫生组织防盲和防聋2个国际合作中心，担任国家防盲技术和防聋治聋技术指导组组长单位，是集医疗、教学、科研、预防、国际交流五位一体的医疗科研联合体。

医院有中国工程院院士1名，国家万人计划人选4名，教育部长江学者1名，百千万工程国家级人选9名，国家杰出青年基金获得者3名，国家优秀青年基金获得者1名，省部级突出贡献专家10名，北京学者4名，青年北京学者3名，拥有28个研究生学位点，14个博士学位点，博士生导师73人，硕士生导师202人，有正高级职称260余人，副高级职称400余人，医学英才辈出，医疗力量雄厚，是国家医疗卫生健康领域的人才集聚地和推动医疗卫生事业发展的排头兵。

门头沟绿水青山，未来可期；同仁医院百年传承，享誉中外。门头沟区—同仁医院精诚合作，顺应民心。面对新机遇，站在新起点，开启新征程，必将助力建成京西地区医疗水平和卫生人才新高地，打造区域健康新名片，为京西地区提升医疗卫生服务能力、增加民生健康福祉、建设幸福京西和更加健康美丽的绿水青山，实现健康中国和首都高质量发展战略谱写门头沟新篇章。