厦门医学院附属第二医院口腔科，是集临床、科研、教学于一体的综合性学科，涵盖口腔颌面外科（门诊）、口腔内科、口腔修复科、口腔正畸等专业。门诊现有医护人员16名，其中主任医师1名，副主任医师1名，主治医师7名，住院医师3名；硕士研究生学历8名，形成了合理的人才梯队。年平均门诊量约2．5万人次，采用全预约的就诊流程。

科室拥有综合治疗牙椅16张、KAVO数字化三合一影像系统（口腔CT、曲面体层、头颅正侧位片）、牙片机，法国赛特立高频电刀，SybronEndo根管测量仪、根管马达、根管热牙胶充填仪，计算机控制系统无痛麻醉仪，瑞士士卓曼种植系统、德国BEGO种植系统等专业设备；

具有一套完整、正规的清洗、消毒、灭菌流程和设备：配备大量的高速手机，使用专用预真空蒸汽压力灭菌器、超声波清洗机、自动封口机、手机清洗机等，为杜绝医源性感染，对使用过的手机头、洁牙机头及手术器械均集中处理、清洗、封口打包、灭菌，对进入病人口腔内的所有诊疗器械，做到了“一人一用一消毒或者灭菌”，从而有效的预防了交叉感染。