厦门医学院附属第二医院肾内科是闽西南成立最早的肾脏病专科，始建于上个世纪80年代初，195年被列为厦门市唯一的肾脏病重点专科，2009年为厦门市慢性肾衰竭诊治规划重点专2015年11月加入刘志红院士指导平台，2018年获厦门市优势亚专科建设项目及院级重点学科。

科室承担着医院肾脏病方面的临床、教学和科研任务。目前拥有一支高素质的医护队伍，学科完成、承担国家级及省部级、厅市级科研项目十余项，获省市级

科技奖励7项，发表临床研究论文百余篇。早在20世纪80年代引入血液净化治疗，在血液净化方面具有明显的技术优势。率先在闽西南地区开展了肾脏病理学诊断，对各种原发性与继发性肾脏疾病的诊治及血液净化等方面具有丰富的临床经验，尤其是在疑难性肾脏病的诊治方面具有较高的水平。

新建血透室面积约300平方米，拥有一流的环境、一流的设备、流的人才及一流的技术；可满足不同的治疗需要，目前在科室进行透析治疗的患者已有230余人。