福建中医药大学附属第三人民医院眼科是集临床、教学、科研为一体的科室。科室目前拥有副主任医师1名，住院医师1名，专科护士1名，其中，眼科学医学硕士2名。科室经不断发展成为集医疗、教学、科研、保健、防盲、护眼为一体的临床基地，拥有国际先进的检查和治疗仪器设备，包括电脑验光仪、非接触式眼压计、眼前节照相分析系统、睑板腺红外扫描仪、眼底照相机等设备。   

科室秉承全心全意为病人服务的宗旨，以精益求精的技术、高度的责任心竭诚为广大患者服务。

科室能为患者提供高质、权威的科学诊断，对多种眼病，特别是干眼症、视疲劳、屈光不正、斜弱视等眼科常见病具有良好的诊治效果；对角膜炎、糖尿病视网膜疾病、葡萄膜炎等疑难杂病也有较丰富的临床诊治经验；发展医学验光配镜、建立屈光档案、近视防控等眼视光前沿医疗项目，配合中医药特色诊疗、雷火灸、穴位按摩外治等中西医结合方法防治儿童青少年的斜视、弱视、屈光不正。