福建中医药大学附属第三人民医院针灸科依托福建中医药大学学科优势，是集医疗、预防、保健、康复、美容、教学为一体的综合性诊疗中心。科室共有医师6名，其中副主任医师以上人员1名，主治医师4名，住院医师1名。门诊治疗区有诊室8间，治疗床52张，病房位于四楼二病区，开放20张床位。

科室以中医特色的传统疗法为主，包括针刺、艾炙、穴位注射、穴位埋线、推拿、理疗、牵引、刮痧、火罐、熏蒸、小针刀及中药外治等综合疗法。

主要治疗优势、建设发展方向有：脑病、颈腰脊柱疾病、慢性肠道疾病、妇科疾病调理、中医美容。主治颈椎病、肩周炎、腰背肌筋膜炎、腰椎间盘突出症、膝骨关节炎、网球肘；针对脑瘫、失眠、面瘫、中风后遗症、胃肠病、过敏性鼻炎、痛经、月经不调等疾病疗效显着。同时开展三伏灸、三九灸、针灸减肥、经络调理及针灸美容等节气养生、体质调理等，均取得明显的效果。