福建省级机关医院中医科现有主任医师3名，副主任医师2名，主治医师2名。经过多年的学科建设，中医科在脾胃、呼吸、妇科内分泌、肿瘤、皮肤等学科上有丰富的经验。根据中医理论"未病先防，既病防变"，运用整体观念及脏腑相关理论，充分发挥中医药和中医与现代诊治科学技术相结合的优势，在防治肿瘤术后复发与转移，配合放化疗减毒增效以及肿瘤的并发症等领域具有丰富的经验。

在中医药诊治慢性胃炎、消化性溃疡、功能性胃肠病、习惯性便秘等消化系统疾病，慢性阻塞性肺病、哮喘、慢性咳嗽等方面亦有丰富的经验。对于月经失调、不孕症和更年期综合征等妇科内分泌疾病，注重发挥中医药"整体调节、分期干预、身心兼顾、综合调治"的优势，进行个体化治疗。