新余市妇幼保健院外科成立于2005年，重点发展小儿外科、女性肛肠外科、妊娠合并外科疾病的诊疗，以及腋臭、各种创伤、烧伤等外科疾病的诊疗，为肛肠疾病提供咨询服务。

科室开展小儿疝气、鞘膜积液、隐睾、尿道下裂、小儿肠套叠、肠梗阻、小儿阑尾炎和新生儿脐膨出等疾病的手术治疗。此外，新余市妇幼保健院外科还专业治疗小儿包茎、包皮过长等与生殖相关的外科疾病。