江西省儿童医院心内科是江西省目前唯一的一所由省卫生厅批准授牌的治疗小儿心脏病的专科医疗机构。中心于2002年成立。

由小儿心内科、心胸外科、重症监护室三部分组成，并配备有专职麻醉医师、影像专家(X-ray、ECHO)、手术及监护专科护士。拥有专业医师２０人，其中高级医师１１人，硕士研究生导师2人。中心设置４5张床位，其中重症监护床位16张。目前这种多学科联合优势配置模式的心脏病专业中心在省内仅限于中心。

中心自2002年成立以来，已完成先心手术近1800台，手术成功率97.9%；受术者最小年龄为９天，最低体重2.5kg。其中小于1岁的婴儿占50%，复杂先心占20%；，手术死亡率2.1%。

中心在省内率先开展了多项新技术、新术式：如先心超声分段诊断、超声心动图从病理形态诊断室缺部位、白细胞除滤血在体外循环预充中的应用、低体重体外循环改良超滤技术、平衡超滤技术；深低温停循环、深低温有限体外循环、镇痛泵在婴幼儿复杂先心术后的应用、术后重症监护、米力农、前列腺素E1的应用及胸部体疗在先心术后的应用等。

科室成功开展了新生儿、婴幼儿复杂先心手术，新生儿、婴幼儿危重先心急诊手术，如大动脉转位Switch术、右室双出口纠治术、婴幼儿法乐四联症根治术、重症法乐四联症根治术、11/2心室修补术、婴幼儿完全性房室间隔缺损修补术、婴幼儿完全性肺静脉异位引流根治术、婴幼儿主动脉弓缩窄根治术、右冠状动脉左室瘘修补术、还开展了全腔肺动脉吻合术等，填补了省内空白。

尤其在婴幼儿危重、复杂先心手术诊治方面，中心一直处于省内领先水平。目前在心内科房间隔缺损、室间隔缺损、肺动脉狭窄、动脉导管末闭手术成功率为100%，法乐四联症手术成功率为96.9%。