安徽省肿瘤医院腹部肿瘤外科是该院重点科室之一，同时也是安徽省立医院普外科（国家重点科室）在西区的腹部肿瘤外科专科。科室专业梯队合理，高、中、初级专业技术人员齐备，拥有多名省知名肿瘤外科专家。目前开放病床56张，医护人员35人，主要对腹部各脏器及软组织肿瘤进行外科手术为主的综合治疗，现分为肝、胆、胰及胃肠、软组织肿瘤两大专业组，专业技术处于省内领先水平。有多名专家承担国家、省级专业学术团体的主委、副主委、常委等，目前承担着多项省、厅级研课题多项。

该科除常规开展肝胆胰、胃肠及软组织肿瘤外科的临床诊疗工作外，还承担多项科研和教学工作。临床上对各种肝、胆、胰恶性肿瘤手术治疗、胆道损伤的修复与重建、复杂肝胆管结石的外科治疗、中老年胃癌的规范化D2根治术，超低位直肠癌（TME）的保肛术。结肠癌完整系膜（CME）根治术，腹膜后、躯干、四肢软组织肿瘤，腹内脏器无法手术切除实体瘤的消融、放射性碘125粒子植入术开创了肿瘤治疗新途径，均获得了良好的近远期疗效。

近期在总院普外科的支持下该科已广泛开展了ERCP和腔镜手术，经内镜胰胆管恶性肿瘤或良性梗阻的诊断，乳头狭窄扩张、置管、支架引流、取石等诊治技术居省内领先国内先进水平。腔镜技术常规开展胆囊切除术、胆总管切开取石术、肝囊肿开窗术、胃癌、结直肠癌等多种腔镜手术，各项技术均居省内领先水平。