复旦大学附属儿科医院安徽医院（安徽省儿童医院、安徽医科大学儿童医学中心、安徽省儿童健康与疾病临床医学研究中心、安徽省儿童医学研究所）是国家发展改革委、国家卫生健康委批准的第一批国家区域医疗中心试点单位，由省人民政府和复旦大学附属儿科医院，依托安徽省儿童医院合作共建，为政府举办的公益性医疗机构。是国务院医改领导小组秘书处确定的建立健全现代医院管理制度试点单位。现有望江路院区、深圳路院区和三里庵院区三个院区。隶属安徽省卫生健康委，是集医疗、教学、科研、预防、保健、康复为一体三级甲等儿童专科医院。是安徽医科大学研究生培养基地，皖南医学院研究生培养单位。

望江路院区占地面积57亩，医疗用房面积6.4万平方米。深圳路院区占地271亩，一期建筑面积19万平方米，三里庵院区建筑面积6千平方米。2019年门诊量121万人次，出院患儿近8万人次，手术2万余台次。开放床位1396张，现有职工1986人，卫生专业技术人员1698名，高级职称265名，博硕士381人。全院拥有2名博士生导师、4个硕士点，2022年在读研究生68名。现有儿科、儿外科、放射科三个专业国家级住院医师规范化培训基地，省级带教师资179人，累计招生300人，结业158人，在培学员125人。为第二批国家级专科医师规范化培训基地（新生儿围产期医学），在培学员12人。近三年举办国家级继教项目23项，省级继教项目26项。设置42个临床医技科室（其中34个临床科室、8个医技科室），7个多学科平台中心。现有国家级新生儿保健特色专科、拥有7个省级临床重点（培育）专科：儿童骨科、新生儿科、儿童心胸外科、儿童康复医学科、儿童肾内科、重症医学科（PICU）、儿童神经内科。

近年来，大力实施科教兴院战略，鼓励开展新项目，支持临床科研，在危重新生儿的抢救、小儿脑瘫、癫痫、哮喘、肾病、消化道疾病、复杂新生儿先天性畸形（如食道闭锁，泄殖腔畸形等）、泌尿道畸形、骨关节畸形、小儿先心病、儿童白血病、肿瘤外科的恶性实体肿瘤规范化诊治、儿童血管性疾病的介入治疗及胎儿磁共振诊断等方面有很高造诣。近三年，开展体外膜肺（ECMO）、儿童内窥镜下逆行性胆管胰管造影术（ERCP）、儿童骨髓移植、儿童腹膜透析、儿童单孔腹腔镜（包括胆总管囊肿，脾切除、重复肾上半肾切除术等）、经血管心脏射频消融术、微波消融术、小下颌畸形矫形、胸腔镜下肺叶切除术等一系列新技术新项目，为疑难重症患儿的治疗提供了有力技术支撑。

先后获得“全国卫生系统先进集体”“全国巾帼文明示范岗”“省直文明单位”“全国院务公开先进单位”“合肥市消防安全能力建设4A级单位”“全国创先争优先进集体”“全国卫生计生系统先进集体”等各种荣誉称号。在“安徽省十大服务行业居民满意度调查”中，2014-2018年连续五年获得“金口碑奖”。

现有红十字童心生命关爱基金、江淮医疗救助慈善行项目、爱心无国界基金、成长天使基金等慈善基金及公益项目。