安徽省儿童医院儿童神经科创建于2002年，安徽省医疗卫生重点专科、中国抗癫痫协会理事单位、全国脑炎协作单位、中国SMA诊疗中心、安徽省儿童抽动障碍协作组理事单位，安徽医科大学小儿神经科专业硕士培养基地，连续数年获得院级先进集体。

科主任杨斌，神经科博士，硕士生导师，儿童神经科知名专家。目前全科共有医护人员58人（医生22人，医技3人，护理33人），其中主任医师1人，副主任医师6人，博士1人，在读博士2人，硕士生导师1人，硕士研究生及在读硕士18人。2021年始复旦大学附属儿科医院神经内科主任周水珍教授指导科室临床、科研发展规划。

儿童神经科现有开放病床90张，设有普通小儿神经科病房、重症监护病房、癫痫病房、视频脑电图监测病房。儿童神经科门诊设有神经内科专家门诊、知名专家门诊、专病门诊，其中专病门诊包括癫痫、抽动障碍、神经免疫、头痛、肌病、生酮饮食、睡眠障碍、进行性肌营养不良、重症肌无力、抗NMDAR脑炎等，为神经科慢病管理创造了良好的条件。

特色诊疗技术：长程视频脑电图监测，用于小儿发作性疾病的诊断、鉴别诊断及治疗指导；脑脊液细胞学检测，为中枢神经系统感染性、免疫性及肿瘤性疾病提供诊断依据，尤其对早期影像学阴性的中枢神经系统肿瘤诊断意义重大；诺西那生钠鞘内注射治疗小儿脊髓型肌萎缩（SMA），已建立该病多学科合作诊疗体系；经颅多普勒颅内血管超声检查技术（TCD），用于小儿头痛或脑血管疾病病因筛查；生酮饮食治疗难治性癫痫；肌肉注射ACTH治疗婴儿痉挛症；儿童心因性疾病的心理学护理干预。

承担小儿神经系统专科疾病的临床教学，及进修、规培、实习、见习医师培养任务。每年定期举办国家级或省级小儿神经系统疾病继续教育学习班1次，为全省本专业医护人员提供学习交流平台。主持和参与主持多项科研项目，共发表SCI及中文核心期刊论文数十篇。已积极筹建儿童神经心理学临床实验室，认真执行科室十四五发展规划，致力打造安徽省小儿神经第一品牌。