北京清华长庚医院全科医学及健康管理科分为全科医学科、健康管理中心2个科室：
全科医学科
是集医教研一体的，以综合健康管理、慢性疾病控制以及症状鉴别筛查为工作重点的临床科室。科室设有门诊、病房以及社区医疗服务。
服务范围包括：急慢性症状鉴别诊断与治疗、健康咨询，以及慢性疾病管理。老年多种疾病（糖尿病、高血压、骨关节疾病等）的综合评估管理，药物调整等是全科医学科的重点之一。此外，肥胖、高脂血症、高尿酸血症等代谢紊乱的治疗指导也是全科医学科重要内容。
全科医学科现有医生7名，其中正主任医师1名，副主任医师1名，主治医师1名。全科医学科用人文理念、全人理念服务于患者，收到社会广泛认可。目前是全国住院医师培训基地以及北京市卫生健康委人文科室。
健康管理中心
北京清华长庚医院健康管理中心于2015.3.31正式运营，本中心独立于门诊区域，位于医院南侧3号楼一层，占地1300平方米。流程在健康管理中心完成，保护隐私、不受拥挤、嘈杂之扰；宽敞、明亮、整洁优雅舒适的体检环境让您体检过程更舒心，先进的仪器设备及强大的医师团队保障您的体检质量。