南部县中医医院始建于1952年，2009年创建为国家二级乙等中医医院，2013年由老城区整体搬迁至新院区，2014年创建为国家二级甲等中医医院。2020年创建为国家三级乙等中医医院，是一所集医疗、教学、科研、预防保健、康养于一体的中医综合医院。国家上消化道癌免费普查项目定点医院、南部县老年病医院。“南部县肿瘤防治中心”，“南部县区域影像分级诊断平台（影像中心）”、“医学病理检验中心”落户我院。医院宗旨为融汇中西，彰显特色，至精至诚，惠泽百姓。

目前，医院布局分为新院区、老院区、养老院医务室，总体占地面积60.76亩，总建筑面积48000平方米，在建业务用房1.67万平方米，编制床位500张，实际开放床位478张。医院编制人数202人，现有在岗职工总人数536人，其中卫生技术人员462人，占职工总数的86%，床位与医师之比1:0.31，床位与护士（师）之比1:0.41；在卫技人员中，研究生5名，正高职称2人，副高职称30人，中级职称74人，县名中医3人。医院于2015年6月成立党支部，2021年8月升格为党委，下设5个支部，现有党员101名。

医院共设临床科室23个，医技科室7个，病区14个；重点专科3个：其中骨伤科、血液病科为市级重点专科；针推、康复科为省级重点专科。医院拥有直线加速器、核磁共振、螺旋CT、DR、电子胃镜、电子肠镜、全自动生化分析仪、麻醉机、彩超、腹腔镜、膀胱镜、呼吸机等5万元以上大型医疗设备95台件，中医特色诊疗设备14类35种332台件，能满足临床工作需要。

医院相继与北京中医药大学、解放军第三军医大学大坪医院、重庆大学第一附属医院、重庆医科大学附属儿童医院、开封市中医院、川大华西医院、省肿瘤医院、内江市中医医院、自贡市中医医院、成都体育学院附属体育医院、川北医学院附属医院、南充市中心医院建立了广泛的合作关系，并成为四川省中医医院、成都中医药大学教学实习医院，四川大学华西医院远程教学、会诊定点医院。2018年牵头与南部县26家乡镇（中心）卫生院、社区卫生服务中心组建南部县中医医院医疗联合体。