玉溪市儿童医院消化感染科共有医护人员23人，其中医师6人（副高1人、主治医师5人），护理17人（主管护师4人、护师9人、护士4人）。编制床位50张。

科室主要承担儿童消化道疾病和传染性疾病及儿科疑难疾病的诊断、抢救及治疗工作。主要收治病种为：腹泻病、胆汁淤积性肝炎、婴儿肝炎综合征、EB病毒感染、巨细胞感染、肺炎、支气管炎、手足口病、水痘、腮腺炎等。科室开展特色检查碳13呼气试验，小儿无痛胃镜检查项目。

特色治疗：小儿推拿、中药穴位贴敷治疗、中频脉冲穴位贴敷治疗及红外线烤灯治疗。