鄂尔多斯市蒙医医院康复科创建于2015年1月，2017年3月设置独立的病区。目前，有19名医护人员，其中12名医生，7名护士，设置病床40张，并设有针灸室、放血室、运动疗法（PT）、作业疗法（OT）、语言治疗室（ST）等专业康复治疗室，配有各类先进的康复理疗设备。

蒙医康复科以蒙医五疗为特色，坚持以蒙西医结合治疗为主的发展方向，与传统疗术有机结合。现开展脑卒中、脑瘫、截瘫康复评定、脑卒中运动、感觉、平衡功能、语言、吞咽功能、智能心理康复训练等。此外，还开展各类骨关节病的功能训练、术后功能训练、物理（运动）疗法、作业疗法、理疗、体操音乐疗法等10多种康复治疗。

主治脑血管病恢复期、脑外伤恢复期、格林巴黎恢复期、周围性神经系统疾病、颈椎病、腰椎间盘突出症、肩周炎症、脚后跟疼痛、膝关节骨性关节炎等各类骨关节疾病、风湿、类风湿、强直性脊柱炎等免疫系统疾病。擅长治疗长期头疼痛症、耳鸣、耳聋、产后风、过敏性鼻炎、过敏性哮喘等疑难杂病。采用传统五疗与现代康复相结合的独特治疗方案，为广大功能障碍患者提供一个高生活质量、回归社会、回归家庭的人性化治疗场所。