菏泽医专附院口腔医学中心作为本院的特色科室之一，是一个集医疗、教学、科研、预防为一体全面发展的医学中心，是口腔专科和临床实习基地。环境优雅安静舒适，布局合理。
目前口腔医学中心共有医护人员42名，其中教授、主任医师2名、副教授、副主任医师9名、主治医师，讲师17名，住院医师、助教8名，护理7名，组建了一支以“诊疗技术为根本，学术创新为发展，优质服务为核心”的精英团队。在附院学科建设领导小组的领导下，确定了本学科发展方向：以病人为中心，建设和发展临床、教学、科研、口腔健康教育并重的口腔医学专科，为鲁西南地区医疗，专科人才培养提供保障。
主要特色和优势如下：
1.科室设备先进：口腔医学中心现有牙科综合治疗椅20台、口腔CBCT、口腔数字化牙片机、进口洁牙机、无痛牙周治疗仪、美白治疗系统、口腔显微镜、全面高温高压消毒等先进医疗设备，严格执行“一人一用一灭菌”的标准。
2.专业齐全：按照专科定向培训骨干，开展了口腔医学12个专业，如口内、口外、修复、正畸、种植、儿童牙病、牙体牙髓病、口腔颌面医学影像等专业，专科综合实力强。
3.职称学历层次高：拥有高级以上职称11人，硕士研究生学历以上25人，在全市职称、学历层次方面位居第一。
4.组建菏泽市第一支口腔护理团队，团队成员不间断轮流到山东省口腔医院进修学习。
5.成立了菏泽医专附属医院口腔专科联盟：积极推动区域内口腔卫生事业的快速发展，与牡丹区中医院、高庄卫生院、胡集卫生院、小留卫生院等20余家单位共同商议，成立以菏泽医专附院为核心的口腔专科联盟，形成辐射区域内的口腔专科诊疗网络框架。目前以扩增至30余家，并积极采取技术帮扶，人才培养，双向转诊，分级诊疗等多种方式与联盟单位开展合作。
6.成立以我院为主委单位的菏泽市医学会口腔健康教育专业委员会，积极推动菏泽市口腔健康教育事业发展。
通过重点学科建设，进一步提高口腔医学中心临床诊治水平，打造合理人才梯队，核心技术达到与国内接轨、省内先进水平，具备解决口腔疑难病例的能力，不断提高口腔健康水平。服务菏泽市及鲁西南地区、成为在鲁西南地区有一定影响的区域性口腔诊疗中心、人才培养、临床科研与技术推广的基地，以满足群众医疗服务需求。
1.口腔颌面外科学科：在宋恒国主任带领下， 创建并形成了一支以口腔肿瘤治疗和修复 、颌面整形、创伤、涎腺、颞下颌关节疾病等防治研究为主要内容的实力较强的医、教、研学科队伍。主要包括：口腔内肿瘤、唾液腺肿瘤及颌面、颈部肿瘤的手术治疗，血管瘤与血管畸形等疾病的诊断和治疗达省内先进水平；智牙冠周炎、口腔颌面部感染的治疗；各类病灶牙拔除及牙槽外科，包括残冠、残根、智齿、多生牙、埋伏牙、正畸牙的拔除，牙槽突修整，牙槽突修整术；颌骨囊肿及根尖囊肿摘除；唇、舌系带矫治等等手术；尤其对复杂阻生牙的拔除，采用了微创拔牙术，明显减轻了术后肿胀及并发症；对老年心血管患者采用心电、血压监护下拔牙，大大提高了安全性；口腔颌面部创伤，颌面部骨折的复位与固定；颌面部创伤畸形的后续治疗；颞下颌关节损伤的治疗及关节强直手术治疗；与中华儿慈会联合开展“微笑行动”，在唇腭裂功能性整复及唇腭裂的序列治疗方面取得了良好的效果，对唇裂术后畸形的矫正有丰富的经验。
2.口腔内科学科 ：逐渐在牙体、牙周和黏膜病等方面形成了一支技术全面、结构合理、有较好发展潜力的学科梯队 。主要包括：龋病、牙髓根尖周病、牙体非龋性疾病（牙隐裂、牙折、牙本质过敏）等，并可对牙体牙髓的各种疑难疾病进行诊治；各种常见口腔黏膜疾病，如阿弗他口腔溃疡、口腔扁平苔藓、口腔白斑、念珠菌性口炎、疱疹性口炎、慢性唇炎、BMS等及疑难病如OSF、天疱疮、多形红斑、CDLE等的诊治； 牙龈出血、牙龈牙槽骨萎缩、牙龈变色、牙龈肥大增生、牙齿松动、口臭、种植体周围炎等牙周疾病的防治。
3.口腔修复学科：在传统技术基础上不断改进，大胆引进新技术，新材料，如氧化锆全瓷冠，纳米烤瓷牙，贵金属烤瓷牙，纯钛支架等，利用Parapost玻璃纤维桩修复残冠，既增加美容效果又减少了患者的复诊次数，极大地改善了美观及功能，受到患者好评。针对牙槽嵴重度吸收的患者开展牙种植套筒冠覆盖义齿修复，使患者重新拥有牙齿。
4.口腔正畸学科：临床工作中除完成常见错合畸形的矫治外，近些年不断开展的具有国际先进水平的高层次、高质量矫治技术：（1）种植支抗技术（2）自锁矫治技术（3）无托槽隐形矫治技术（4）埋伏牙阻生牙矫治等等。
5.种植义齿学科：开展了常规种植，即刻种植，应用了引导骨组织再生技术、骨挤压技术。宋恒国主任率领团队结合3D医学影像、计算机辅助设计和3D打印技术，完成菏泽市首例无牙颌患者即刻负重种植手术，当天即能恢复患者的咀嚼功能，实现了种植患者的精准化、个性化、微创化、经济化治疗，达到国内领先水平。
6.口腔儿童及预防治疗学科：全麻下儿童口腔疾病的治疗、乳牙牙体牙髓疾病、年轻恒牙的牙体牙髓病、儿童乳牙及年轻恒牙牙外伤的初步治疗，龋病预防、窝沟封闭、脱敏治疗、涂氟等口腔预防保健。
7.颞下颌关节学科：我院颞下颌关节学科是国家卫生健康适宜技术推广项目“四联保守治疗技术在颞下颌关节紊乱病精准治疗中的应用和推广”、广东省卫生健康适宜技术推广项目“稳定性咬合板在颞下颌关节紊乱中的应用和推广”的实施科室，是咬合及颞下颌关节病诊疗的专业科室，我院先后派医生团队前往广州医科大学附属口腔医院学习先进的诊疗理念及诊疗技术，现科室广泛开展颞下颌关节紊乱病、口颌面痛、重度磨损、咀嚼功能障碍和磨牙症等咀嚼系统功能紊乱病的诊疗工作。