重庆医科大学附属第一医院金山医院消化科创建于1957年，由上海第一医学院部分西迁而来，经过几代人的不懈努力，现为博士、硕士学位授予点，国家临床药理基地，重庆市消化疾病诊疗中心，集临床、内镜诊疗技术、科研、教学和优质护理于一体的消化专科，尤其是近年来在消化心身疾病诊治和内镜诊疗技术方面取得长足的发展，达到国内先进水平。
金山院区消化科本着“精专科，大中心“的理念，重点发展特色专科及内镜特色中心。由住院部、门诊及内镜中心三部分组成，现有床位22张，年住院患者约1000人次，年门诊量约3万人次，内镜中心诊治约1.2万人次。现有医师9人，高级职称4人，中级职称4人。开展了肿瘤早癌、消化心身疾病、功能性胃肠病、难治性幽门螺杆菌、难治性胃食管反流病、炎症性肠病、慢性肝胆胰疾病诊治等特色专病门诊。
金山院区内镜中心成立于2014年，总面积达1500平方米，集内镜下诊断、治疗、科研、教学为一体，是目前西南地区最大、设备最先进、检查治疗项目最齐全的内镜中心之一。开展了内镜黏膜下隧道食管病损切除术、内镜黏膜下包块剥离术、超声内镜诊治技术、食管静脉曲张套扎术、胃底静脉曲张粘合术、食管支架植入术、经皮胃造瘘术等内镜高级别先进技术。
科室始终坚持创新求发展，注重人才引进、培养、技术创新和发展，自成立以来已培养专业研究生数十名。通过营造“和谐、进步、拼搏、奉献”的科室文化，使医护人员树立”以患者为中心“的理念，开展优质护理，提升患者满意度，竭诚为广大患者服务。