遂宁市中医院儿童保健科成立于2009年，2022年荣获全国“第一批孤独症防治规范化建设项目建设单位”，2023年获建遂宁市临床重点专科。是全市最早成立的儿童保健专业科室，是集保健、科研、管理、教学为一体的专业科室。

科室以全面促进儿童的身心健康为宗旨，长期致力于为广大儿童及家长提供有关儿童生长发育、心理发育、行为问题的专业诊治、健康教育、指导与咨询。科室还负责全市儿童保健业务指导，基层儿童健康管理指导，托幼机构卫生保健工作指导管理，为推动全市儿童健康事业的发展，引进国内外先进的保健教育新理念及各种专业技术手段，由资深儿童保健专家坐诊，为父母和儿童提供全面的、序贯性的、个体化的健康促进服务，促进儿童全面可持续的健康发展。

科室队伍由医师团队、护理团队、康复治疗师、早教特教团队组成。其中，副主任医师3名，主治医师1名，住院医师1名。心理咨询师1人，高级营养师1人，儿童保健护师5人，小儿康复、推拿师4人。

科室分两个院区：天峰街院区和和平路院区。