黔东南州中医医院，是本州唯一的一所三级甲等中医医院，是全州中医、中西医结合及民族医药医疗、教学、科研中心。系贵阳中医学院第四附属医院、贵阳中医学院硕士研究生培养单位。

门诊部设有内科、外科、骨伤科、针灸科、皮肤科、妇产科、五官科、口腔科等诊室；专设急诊科；全院开设床位450张，设置10个病区，内一科、内二科、内三科、内四科、外一科、外二科、骨伤一科、骨伤二科、针灸科、妇产科。另设有药剂科、检验科、功能科、胃肠镜室、病理科、治未病科、输血科、血液净化中心、供应室、麻醉科、手术室等科室。设置17个行政管理科室。

全院拥有德国西门子高速磁悬浮64层螺旋CT机、多功能DR、CR数字X光机、C臂机、数字化多功能X线胃肠机、GE及西门子彩色B超、电子胃肠机、膀胱机、腹腔镜、胆道镜、输尿管肾镜及气压弹道碎石系统、钬激光碎石系统、等离子前列腺电切仪、射频消融热凝仪、全自动生化检测系统、高档病理检查系统以及臭氧治疗仪、经络导平治疗仪、子午流注治疗仪等一批中西医诊疗设备。

内科方面以治疗各种老年病、心血管系统疾病、呼吸消化系统疾病、糖尿病、肝病、风湿病为主。妇产科方面可开展正常分娩接生、剖腹产、运用中医中药治疗各种妇科疾病、不孕不育等。外科方面可开展上下腹部、四肢、脑部等手术治疗。针灸推拿理疗治疗中风后遗症，特别是运用银质针、小针刀、火针、浮针和三维正脊仪治疗颈肩腰腿痛疗效显着。引进臭氧技术治疗中风及其后遗症，腰椎间盘突出症，取得了很好的疗效，填补了州内技术空白。

苗医肺病科、针灸科是国家级重点建设专科，苗医肛肠科、眩晕病专科等4个专科是省级重点建设专科，苗医脾胃病学科是省级重点建设学科。