温州市中心医院中医科建立于上世纪五十年代，有着悠久的历史和优良的传统。目前中医科科室人员12名，有副主任医师6人、主治医师3人、住院医师3人，其中温州医学院兼职中医学教师1人。

设有中医糖尿病专科、老年病专科、中医肿瘤专科、中医肝病、中医妇科、中医儿科及中医病房。中医科主要承担中医门诊、中医病房、全院各病区中医会诊等诊疗任务，同时兼任医学院校中医系的临床带教任务。

全年门诊量近八万人次，中医内科在各种肿瘤、老年病、糖尿病、肝病、胃肠病等，中医妇科在宫血、月经失调、痛经、产前后疾病等，中医儿科在小儿常见病、小儿咳喘症、小儿胃肠病、小儿抽动症及多动症等方面均积累了丰富的经验和治疗方法。

中医病房拥有12张床位，以中西医结合治疗糖尿病、肝病、老年病为特色，在温州群众中享有较好的口碑。科室还承担多项局级的科研课题。