南京医科大学附属逸夫医院消化内科，是医院重点建设科室，已投入3千万元用于硬件建设，设有消化内科门诊（专科和专家门诊）、消化内科病房、消化内镜中心、消化实验室。在人才建设方面，学科由南京医科大学第一附属院（江苏省人民医院）消化科主任张国新教授和徐顺福主任医师领衔组建，现有15人，其中博士8名，硕士4名，主任医师6名，副主任医师2名，主治医师4名，住院医师4名。

消化内镜中心位于住院楼二楼，占地2700余平米，是医院重点建设项目，内设候诊区、普通胃肠镜检查室、无痛胃肠镜检查室、超声内镜检查室、ERCP手术室、ESD手术室、腔镜手术室、以及复苏室。拥有最先进的日本奥林巴斯290内镜主机系统6台（包括胃镜、肠镜、放大染色内镜、十二指肠镜、小肠镜、胆道镜）、线阵超声内镜及规范的内镜消毒及清洗系统，并拥有飞利浦ERCP X光机。开展项目包括常规胃、肠镜检查，无痛胃、肠镜检查，超声内镜检查，早癌筛选和精查，小肠镜检查，内镜逆行胰胆管造影（ERCP）诊断和治疗，如IDUS、胆管取石术、胆道支架置入术，以及胃肠道异物取出术，胃肠道支架置入术，食管、胃底静脉曲张破裂出血的硬化剂、套扎治疗，胃肠道息肉及癌前病变EMR、ESD术等。

消化内科病房开展床位30张，常规收治消化系统常见病、少见病及疑难病例，包括胃肠道炎症性病变，胃、十二指肠溃疡，胃肠道息肉、肿瘤，胆管结石、胆管炎，胰腺炎、胃肠道出血、病毒性肝炎、肝脏损伤、肝硬化、肝脓肿等。对于常见疾病的治疗有丰富的治疗经验。