中国人民武装警察部队新疆总队医院位于新疆维吾尔自治区乌鲁木齐市沙依巴克区南昌南路669号，是自治区、乌鲁木齐市和兵团城镇职工基本医疗保险的定点医疗机构。

2005年11月14日，医院挂牌“三级甲等”医院；2006年7月28日，医院又荣膺全军“先进医院”、全军“信息化建设先进医院”、全国百家”诚信医院“、国家”A级守信医院“、通过ISO9001:2000国际质量认证五项殊荣。2006年官兵就诊满意率达到98.6%。　　

医院以肝胆外科为龙头的专科建设成效显著，为武警新疆总队医院迈入全军先进医院打下良好基础。医院的肾结石体外碎石术走在自治区前列，成功地完成了全髋和全膝置换术、鼾症治疗术、心脏永久起搏器植入术、肾移植术等多项新技术，使医院取得了良好的社会效益和经济效益。