根据脑膜炎不同的病因进行治疗。大多数的病毒性脑膜炎不需要抗病毒治疗，在大多数情况下以支持治疗为主，必要时可以考虑阿昔洛韦抗病毒治疗。真菌性脑膜炎，可以使用两性霉素B进行经验性抗真菌治疗，在脑脊液检查确定了特定的真菌后后，再给予有针对性的抗真菌治疗。细菌性脑膜炎选用头孢吡肟、头孢曲松或万古霉素等治疗。