中国人民解放军新疆军区总医院前身为国民党联勤总部第60医院，新疆和平解放后，1950年1月整编建院。2016年隶属陆军建制，改称新疆军区总医院。医院是一所集医疗、教学、科研、预防、保健为一体的大型综合性三级甲等医院，是新疆维吾尔自治区、新疆生产建设兵团以及乌鲁木齐市医疗保障制度改革定点医疗单位。

医院是中国人民解放军空军军医大学（原第四军医大学）、新疆医科大学、石河子大学医学院的临床教学医院和研究生联合培养点以及国家住院医师规范化培训基地。医院展开治疗床位1500余张，展开科室50余个。医院在职员工2000余人，其中高级职称200余人，博士、硕士200余人，80余人当选为全国、全军学术专业委员会委员。年门诊量100余万人次，收容量5万余人次，手术量2万余例次。全院占地面积19.13余万平方米，建筑面积近30.00万平方米，医疗用房面积12.91余万平方米，在用医疗设备近4000余台（件、套）。其中，PET/CT、3.0核磁、双源CT、直线加速器、四维彩超、γ刀等骨干设备，居新疆一流水平。拥有全国博士后科研工作站1个，全军专科中心5个（全军骨科中心、全军临床检验诊断中心、全军睡眠障碍诊疗中心、全军消化病专科中心、全军二级医学情报科技查新站），军种或原大军区医学专科中心9个（原兰州军区临床医学研究所中心、原兰州军区睡眠障碍诊治中心、原兰州军区癫痫与功能神经外科中心、原兰州军区医学影像中心、原兰州军区呼吸内科中心、原兰州军区烧伤中心、原兰州军区病理中心、原兰州军区肾脏病中心、原兰州军区普通外科中心），全国全军培训示范基地、新疆自治区特殊环境医学重点实验室等20余个，近年获得各级各类课题和科技成果百余项。