上海交通大学医学院附属新华医院崇明分院小儿外科始建于1915年，是岛内唯一一家集病房、急诊、门诊三个部门的完整儿科，承担岛内大部分儿童的医疗工作。近几年来，依托新华总院儿科强大的医疗及技术资源，临床诊治水平逐年提高，在崇明地区位居首位。病房固定床位共18张，（其中新生儿监护5张）。现有医师16名，在职医师13人，其中高级职称3人，中级职称9人，初级职称1人；返聘医师2人均为高级职称。护士18人，其中主管护师5人，护师8人，护士5人。儿科现有新生儿、呼吸、神经、感染，性早熟诊治等专业。医疗特色新生儿科：新生儿病房成立于1994年，是崇明地区唯一的新生儿专业病房。二十多年来承担了崇明地区70～80％新生儿疾病（包括极低出生体重儿、呼吸暂停、缺血缺氧性脑病、颅内出血、呼吸窘迫综合症、新生儿溶血病、新生儿败血症、自然出血症等）的诊治工作。成功救治了1000克超低出生体重儿，为崇明医学史上首例。呼吸专科：呼吸专科主要对哮喘，慢性咳嗽等慢性呼吸道疾病制定精准有效的管理方案。感染专科：针对各种感染疾病的诊断和治疗，包括EB病毒感染、CMV病毒感染、肠道感染、泌尿系感染和各种病原引起的肺炎都可以在岛内得到有效的救治。内分泌专科：增高门诊的建立，使性早熟和矮小症在崇明岛就近就医，这类病人不用再去上海就医，减少了治疗和复诊来回跑上海的历史，增加了患者的就医体验，减轻了家长的负担。儿童保健专科：主要开展儿童生长发育监测、儿童营养、婴幼儿喂养指导、儿童心理行为发育评估，拥有多种儿童发育行为心理评定量表、婴幼儿语言发育筛查量表。对儿童心理和行为异常进行有效的干预，使儿童心理健康发展。儿童保健科0获批上海市第一批儿童早期发展基地，为崇明区儿童的健康提供了保障。