杭州西溪医院内分泌科成立于2012年目前拥有20张床位的独立病房、3个亚专科：内分泌代谢病诊疗亚专科、脂肪肝-肥胖诊疗亚专科（全国脂肪肝规范诊疗中心）、肝源性糖尿病诊疗亚专科。

科室诊疗重点为慢性代谢性疾病（糖尿病、痛风、肥胖、脂肪肝），甲状腺疾病、骨质疏松、肾上腺疾病、垂体等疾病诊治。

科室现有20名医护，主任医师1名，副主任医师3名，副主任护师2名、糖尿病专科护士2名、硕士及以上学历5名全科医师均在国内外各大医院完成内分泌专业临床培训。

配有胰岛素泵、连续动态血糖监测仪、神经病变检查治疗仪、眼底照相机、ABI检测仪、肝脏Fibrotouch、体脂成分分析仪等专科设备和众多的学科共享设备。