呼伦贝尔市蒙医药事业在70年的发展历程中，经历了从无到有、由弱到强的变化，尤其是近年来在国家、自治区、呼伦贝尔市一系列支持蒙医药发展的政策惠泽下，蒙医药事业取得了长足的发展与进步。2008年，内蒙古卫生厅批准成立呼伦贝尔市蒙医医院，按二级甲等医院进行建设，市委、市政府将蒙医医院建设项目列为20个公共公益建设项目之一，投资5000多万元进行重点建设。医院2010年建成，2011年迁入新址，2012年正式开业，2013年晋升二级甲等医院，2016年晋升三级乙等医院，2017年获批中医药健康旅游示范基地（国家健康旅游会员单位），2018年获批自治区蒙医药文化宣传教育基地和国家第二批住院医师规范化培训基地，2019年获批内蒙古自治区首批蒙医中医名院。短短十年间医院取得了跨越式发展，成为一所以蒙医药为主，集临床治疗、科研教学、预防保健、蒙药制剂、医养结合、健康旅游、国际交流、草药种植等为一体的三级乙等蒙医综合医院，承担着呼伦贝尔地区蒙医药文化传承、发展和国际交流的重任。

蒙药制剂室是呼伦贝尔地区规模最大、设备先进的蒙药制剂研发中心，已通过GPP认证，制剂品种达132种，年产量10000公斤。这些制剂验方合理、疗效确切、安全可靠，深受广大患者的认可和信赖。

呼伦贝尔市蒙医医院建有建有国家重点建设专科1个（蒙医五疗科），自治区医疗卫生领先学科1个（蒙医五疗科-针灸推拿学），自治区蒙医重点特色专科专病4个（心病科、脑病科、肝病科、心身医学科），呼伦贝尔市重点蒙医特色专科专病9个（脑病、心病、骨伤、肛肠、风湿、五疗、肝胆、布病、过敏性紫癜）。自治区草原英才1人，自治区老蒙医学术经验指导老师10人，自治区基层名蒙医1人，呼伦贝尔市名蒙医5人。承担着内蒙古医科大学蒙医药学院、内蒙古医科大学鄂尔多斯分院、内蒙古民族大学蒙医药学院、呼伦贝尔职业技术学院的临床带教工作，也是内蒙古医科大学和内蒙古民族大学的研究生培养基地，硕士生导师6人，在培研究生8名。承担各级科研项目共18项，其中国家级3项、自治区级11项、市级4项，呼伦贝尔市级非物质文化遗产代表性项目——蒙医敷血疗法、布里亚特传统绵羊疗法、小儿巴日呼疗法。

承担制定自治区蒙医药标准化项目《蒙药材蓝盆花、多叶棘豆、小白蒿标生产规范及标准制定》和《3种“地格达”（肋柱花、梅花草、扁蕾）类蒙药材标准化种植技术研究》项目，在对特色蒙药材产地自然条件、育苗技术、栽培与田间管理、病虫害防治、采收加工等方面制定生产技术标准，初步形成行业标准和地方标准，为特色蒙药材规范化种植（GAP）基地建设提供技术支撑，奠定科研基础。同时积极推进呼伦贝尔地区蒙医药文化传承，拓展蒙医药研究新领域，不断提升蒙医药科研能力，与内蒙古民族大学蒙医药研究中心合作成立呼伦贝尔分院，致力于呼伦贝尔蒙医药挖掘整理、蒙药资源普查与蒙药栽培技术研究、特色蒙药验方研究等，编写出版《呼伦贝尔蒙医验方集》等3部著作。多项科研成果获奖。