阜康市中医医院始建于1970年，于1988年改建为阜康市中医医院，经过四十余年的发展，已成为阜康地区中医特色突出、优势明显、设施完备、管理规范、技术精湛、百姓信赖、政府满意的综合性二级甲等中医医院。

医院占地面积2万多平方米，业务用房面积2.1万平方米。医院现有编制75个，截止目前，全院职工总数人251人，专业技术人员占全院职工比例为85.26%，中医类别执业医师占执业医师总数的比例60.42%。

编制床位160张。医院设有住院部、门诊部、社区卫生服务站等；科室有针灸理疗康复科、心病脑病科、内科、儿科、妇产科、外科、骨伤科、肛肠科、药剂科、检验科、医学影像科等临床医技科室21个。医院针灸康复科被列为自治区农村医疗机构针灸理疗康复特色专科建设项目；心病脑病科被列为自治区农村医疗机构中医特色专科建设项目。

拥有日立7180全自动生化分析仪、数字化摄片机（DR）、美国GE彩色多普勒B超仪、日本全自动血液分析仪、胃肠机、C-型臂、动态心电分析仪、AU3超声成像仪、血流变仪、中央监护系统、龙式颈椎牵引机、全科腰椎治疗仪、电脑骨伤愈合仪、全科弧形治疗仪、红外偏振光治疗仪等大中型医疗仪器设备。

先后荣获“全国中医药系统创先争优活动先进集体”、“全国中医医院优质护理服务先进病房”、“自治区级文明单位”、“自治区级政风行风建设示范窗口”、州级“医德医风示范医院”、州卫生系统“党风廉政暨纠风工作先进单位”等荣誉称号，2009年-2013年连续五年获得市“科学发展好班子”称号，2010年-2012年连续三年获得市“卫生系统综合目标考核一等奖”。