连云港市妇幼保健院小儿外科担负着本市及周边地区小儿外科疾病的临床诊治等重要任务，科室配备小儿腹腔镜、小儿专用麻醉机、呼吸机、心电监护仪、新生儿温箱以及其他重症监护设备等，为小儿尤其是新生儿、婴幼儿手术的安全性及危重症患儿的成功抢救创造了必备条件。

学科已经建立起一整套适合小儿特点的精细操作规程以及专科治疗和护理常规，可独立开展小儿各种先天性畸形、急腹症、肿瘤、创伤、泌尿生殖器官疾病和新生儿外科疾病的诊治。

目前，专业内设有新生儿外科、小儿普通外科，小儿骨科及矫形外科，小儿泌尿外科等亚专业。

主要服务对象为14岁以下儿童。儿外科团队由2位主任医师、1位副主任医师、1位主治医师及3位住院医师组成，其中硕士1名，在职硕士3名。